零代码系列之三教你如何看懂WGCNA分析结果

上一节课已经成体系的讲解数据下载到处理完成完整过程,本节可开始讲解如何一键式WGCNA工具使用。1、WGCNA方法总结;2、一键式WGCNA操作说明;3、结果的解读以及参数的调试;4、目标模块分析。

上一节课已经成体系的讲解数据下载到处理完成完整过程,本节可开始讲解如何一键式WGCNA工具使用和分析结果如何解读。

1、首先先看下文中对WGCNA分析方法的的步骤和计算公式,然后看下总结结果。attachments-2018-12-CRzGUj0I5c0e1740a7c98.pngattachments-2018-12-1ZgPVx5X5c0e17566b3d4.png

2、一键式WGCNA软件介绍,这里我就不再次解读,听讲解老师的吧

attachments-2018-12-CEqTRSJA5c0e1881c84a8.png3、解读完毕,那么我们开始实操,小伙伴们一定要跟上

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出现这个了是什么情况呢?不要急这个是提示你的wgcna没有运行成功,听听老师是怎样排查问题。

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终于结果出来了,Yeah

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4、结果已经出来了,那么让我们看看结果都是什么意思吧,离群样本如何删除

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软阈值β怎么选择

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聚类结果判定

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临床特征关联分析

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共表达网络构建

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模块与表型相关分析

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5、最后就是目标模块基因的选择

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那么今天的课程就到这里结束了,大家是不是有种意犹未尽呢,敬请观看下一节课的目标模块的功能富集分析


#164

  • 发表于 2018-12-10 15:54
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  • 分类:软件工具

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