零代码系列之三教你如何进行功能富集

上一节课讲解如果使用工具盒中一键式WGCNA软件并且找到共表达模块,那么接下来我们看下如何获取目标模块基因集,已经目标模块的具体有哪些功能。1、功能模块基因获取;2、在线富集分析操作步骤;3、富集结果两种可视化方法。

上一节课讲解如果使用工具盒中一键式WGCNA软件并且找到共表达模块,那么接下来我们看下如何获取目标模块基因集,已经目标模块的具体有哪些功能。

1、首先是书接上文,接着上一节课的分析结果通过相关模块找到与表型相关性最高的部分

attachments-2018-12-PBx1Xfk15c0e1dcc8a0ab.png

2、模块柱状图结果展示和调整,文章中类似图形复现

attachments-2018-12-Tg8RsjQx5c0e1dfc17fe6.pngattachments-2018-12-yQoJ94w55c0e1e33bef45.png

3、接下来就是在线富集软件分析,这个我们之前两个系列里面也已经有过使用

attachments-2018-12-NOS6gzm05c0e1e733fdb7.pngattachments-2018-12-jfciQu1G5c0e1e634b7e8.png

4、富集结果的解读,这个刚出门的小伙伴还是可以认真学习下

attachments-2018-12-ZPelS3AX5c0e1eacda566.png

富集结果通过cytosacpe可视化

attachments-2018-12-Lr98bJVe5c0e1ec773da5.png

清凉版结果的调试

attachments-2018-12-pWeHD1XY5c0e1f534c76a.png

最终版结果的展示

attachments-2018-12-N5s1NOKb5c0e1f7172aa0.png

柱状图结果展示方法,太简单,哈哈哈

attachments-2018-12-iHxJbOF25c0e1f9099223.png


那么到这里,我们这节课也讲解完毕,下一节课将是我们本系列的最后一讲,关键基因验证,大家已经不要错过哦。


#165

  • 发表于 2018-12-10 16:14
  • 阅读 ( 4930 )
  • 分类:软件工具

0 条评论

请先 登录 后评论
不写代码的码农
调研图

38 篇文章

作家榜 »

  1. 祝让飞 118 文章
  2. 柚子 91 文章
  3. 刘永鑫 64 文章
  4. admin 57 文章
  5. 生信分析流 55 文章
  6. SXR 44 文章
  7. 张海伦 31 文章
  8. 爽儿 25 文章