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祝让飞 - 生物信息工程师生信一期

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1139 个回答

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GEO2R的话需要将β值转换成M值，转换成M值后和芯片数据的差异分析就差不多了

回答于 2019-03-25 16:32

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样本数据全是NaN 是因为你的在导出时数据列没有选择正确，其他临床特征没有提取出来是因为作者并没有将这些数据打包到下载文件中，需要手动下载一下了

回答于 2019-03-25 16:30

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这个版本已经过时了，请用最新版V16：http://sangerbox.com/

回答于 2019-03-25 16:29

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都做到这么具体了，直接实验证明比较靠谱

回答于 2019-03-25 16:28

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用什么打开的文件呢，有截图吗

回答于 2019-03-25 10:50

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用什么打开的文件呢，有截图吗

回答于 2019-03-25 10:50

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你是用ID转换吗？如果是的话是最后一列不是数字列导致的，当多个对应一个基因时程序把他当做数字来处理了

回答于 2019-03-25 10:45

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这应该是测序数据，作者没有把定量结果上传

回答于 2019-03-25 10:42

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那就是没有导出成功，检查一下是不是数据只下载了一部分文件名出现（part）之类的一般是部分数据

回答于 2019-03-25 10:38

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检查样本分组文件第一列和表达谱第一行是否是一样的

回答于 2019-03-25 10:37