祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

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1139 个回答

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miRNA_lncRNA 的lncBase数据在哪下载

看这里:https://shengxin.ren/article/485 介绍

回答于 2019-03-28 06:13

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批量生存分析工具输出结果的基因个数比输入的矩阵少了几百个,这...

少的这些基因无法计算生存分析,可能由于表达值大多数为0或者值域区间很大导致的

回答于 2019-03-28 06:12

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使用DECenter-V6的问题

检查一下右侧分组列选择是否正确

回答于 2019-03-28 06:11

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miRNA_lncRNA 的lncBase数据在哪下载?不是说咱们生信人已经下载...

下载链接:http://report.sangerbox.com/wangjy/lnc2miRNA_symbol.txt

回答于 2019-03-28 06:09

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得到甲基化差异区域注释只有upstream,downstream,UTR5,UTR3,外显...

upstream、downstream表示上下游,启动子区域 目前没有金标准,都是自己根据经验定义的,比如上游2kb到下游500bp

回答于 2019-03-27 02:52

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GEO打不开,已经注册完成但无法连网,怎么办?

早就改版了呢,用最新版的盒子啦:http://sangerbox.com/

回答于 2019-03-27 02:50

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怎么验证COX预后模型

既然是验证预后模型 那么你首先要拿你的模型(公式),用新数据代入进去计算新数据的risk score然后再看他们预后是不是和测试集一致

回答于 2019-03-27 00:47

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GEO便捷转换器工具故障

选择文件,要下载mini格式的压缩文件导入

回答于 2019-03-26 21:41

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你好,我遇到RAM Express不能将cell和cdf进行整合,按照GEO视频...

这是RMAExpress软件兼容性问题,可能你的系统缺少软件运行所需要的某些库文件,试试在其他电脑上跑一下

回答于 2019-03-25 16:34

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GEO中GPL16956平台,没有genesymbol信息,只有ID和SOPT_ID,请问...

拿这些序列重新比对一下,重注释

回答于 2019-03-25 16:33