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简易TCGA中下载列表中都表示什么？
這个问题好大，TCGA的下载列表主要包括TCGA中可以免费下载的各种数据比如临床病理资料、RNA-Seq、甲基化、miRNA、SNV等等，可以从名字中看出来啦
回答于 2017-04-30 17:11
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TCGA中下载的转录组数据包含mRNA，该如何提取mRNA的数据呢？
首先TCGA下载的RNA-Seq数据主要包括三种编码蛋白的基因，假基因和非编码RNA(主要是lncRNA),提取的话可以参考下面两个问题的答案： 1、新版TCGA中表达数据下载后有6万多个ENSG号，其中包含了lncRNA,如何提取lncRNA的表达数据 2、python 实战任务之如何提取fasta头部信息
回答于 2017-04-28 13:32
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TCGA里面的下载的临床XML文件是怎么转临床数据文本的？
1、自己写脚本根据xml格式进行提取临床病理资料，每个样本都有对应一个xml文件 2、使用简易TCGA下载工具V6版本的ClinicalFull按钮进行提取。
回答于 2017-04-28 13:26
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TCGA的bam和vcf下载
这个很难申请的，除非你有非常明确的证据证明你确实需要这个数据，不然基本上很难成功，所以建议你考虑找其他途径，比如找有账号或者数据的单位合作。 当然你也可以看看这个是否有用：https://www.shengxin.ren/article/26
回答于 2017-04-11 11:22