祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期
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1139 个回答

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生存分析点批量运行后，结果为啥一直出不来

你的表达谱数据离群值太多需要进行一下标准化

回答于 2018-01-12 10:10

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DECenter结果

Tumor-Normal.txt文件记录的是所有的基因的差异情况，Tumor-Normal.Dif.txt记录的是根据你软件设定的阈值筛选之后的差异基因，你这种情况可以自己手动从Tumor-Normal.txt中使用适当的阈值筛选一下看看

回答于 2018-01-12 10:06

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批量生存分析 KM曲线分位数和均值 应该选哪种

建议选择中位数，FPKM数据极易出现离群值影响，选择中位数比较合适

回答于 2018-01-12 10:03

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批量生存分析导出结果怎么打开

导出结果可以使用Excel打开

回答于 2018-01-12 10:02

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tcga ensgid转换器可以提供下载链接吗？工具里没有

明后天就更新上去，耐心等一下

回答于 2018-01-08 21:08

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批量生存分析结果感觉排序及P值有问题

问题1:8.6和4.3后面一大串是用的科学计数法没有显示出来，你导出或者复制出来就可以看到其实他很小 问题二：接问题一

回答于 2018-01-08 21:07

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DECENTER处理数据时提示不能分配大小为115.8的向量

你的电脑内存太小了，跑不动你的数据，建议换更大内存的电脑

回答于 2018-01-08 21:05

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如何用TCGA下载小工具merge以后得到RPKM而不是counts的合并数据...

如果是V9之前的版本的话，修改fileID.tmp文件，在最后增加一列指定合并文件中的哪一列，比如2表示第二列。V9版本的话自动合并的是RPKM

回答于 2018-01-08 21:04

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下载好火山图工具后点击启动没反应怎么回事

启动较慢，需要耐心等待一会儿

回答于 2018-01-08 21:03

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关于days to last followup问题

负值直接剔除，不要入组就行，TCGA有些数据是这样的

回答于 2018-01-08 21:02