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已注册账号，但使用DECenter时登陆不进去
建议使用生信人工具盒V8版或者无界版，里面包含了这个工具，地址如：https://www.shengxin.ren/article/222
回答于 2018-01-20 15:21
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画ROC曲线
建议使用R包里的pROC，例子如下： fit <- survivalROC(Stime = time, status = status, marker = riskScore, predict.time = 10, method = "KM")optimalCutoff <- fit$cut.values[which.max(fit$TP - fit$FP)]ROC.1<-fitplot(ROC.1$FP,ROC.1$TP,type='l',xlim=c(0,1),ylim=c(0,1) ,xlab='FP',ylab='TP',main=...
回答于 2018-01-16 20:17
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TCGA中miRNA profiling下载完，合并后merge.txt错位
因为合并时第一个文件的所有列都会保留的，所以数据才会有两列错位的情况，你删掉那两列，右侧数据往左移动就OK
回答于 2018-01-16 20:14
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DECenter 参数值
答1：选择的方法这里，如果是芯片数据建议使用limma，RNA-Seq counts数据使用DESeq 答2：logFC和p只卡最终的差异结果，所以只与第二个文件相关 答3：三个文件本身就是不同数据格式的，第三个是表达矩阵，第二个是根据你设定的阈值筛选出的差异，第一个是所有基因的差异信息，火山图用第一个文件
回答于 2018-01-16 20:06
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祝老师，我重新下载了64bit无界版，V8，打开软件后点击小工具完...
为啥你的电脑字体那么大。。。，你尝试鼠标移动到工具右下角有木有变 手型 再点击试试 看来马上要更新V9版了。。。
回答于 2018-01-16 20:02
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