这都焦灼21个小时了,不知道还来得及救一下不,登录问题看这里:https://www.shengxin.ren/question/315 伪装license.user文件,免登陆
回答于 2018-01-06 18:40
下载这个,然后用GEO芯片转换器进行转换,就好了,国内大多数下载GEO都挺困难的,可以找朋友帮忙下载看看
回答于 2018-01-06 18:35
甲基化的芯片肯定转不了啊,一般甲基化芯片是按照cpg位点设计的,他更多的是对应基因组上的某一个位置,你非得对应到基因的话一般我们都是看基因启动子区域的甲基化水平,而不是基因上的甲基化水平 ,你得先理解甲基化与基因的关系。
回答于 2018-01-06 18:32
这个跟你导入的数据有关,你导入的数据本身就是这个ID,要选择gene名称,你需要将你自己的矩阵进行转换一下
回答于 2018-01-06 18:30
没有明白你的意思,counts矩阵和fpkm矩阵中的ENSG编号都是一样的,小工具有提供提取lncRNA和编码基因的功能,大约有一万八左右的编码基因和一万五左右的lncRNA,他是根据biomart进行转换的,不知道你纠结的点在哪里
回答于 2018-01-06 18:29