祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期
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1139 个回答

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批量生存分析

50%指的就是中位数

回答于 2017-12-29 12:37

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为什么TCGA简易数据库ENSG_ID转换得到的基因数和在Ensembl转换得...

会有一些小差别，TCGA简易工具里的ENSG_ID是基于biomart进行转换的

回答于 2017-12-29 12:35

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TCGA RNASeq数据归一化FPKM数据可否使用Z-Score归一化

可以使用z-score，本质上没有差别，TPM都是大于零的，Z-score会存在小于零的

回答于 2017-12-29 12:14

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想问问TCGA简易下载工具的SNV只有Muse和VarSan2?

SNV的是有四种的，你仔细找找

回答于 2017-12-28 21:37

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关于数据下载后导入EXCEL中有大量数据空白的问题

是什么数据呢？RNA-Seq、临床随访、甲基化、SNP?

回答于 2017-12-28 21:19

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登陆失败

已经部署到阿里云上，现在请尝试登陆应该可以了

回答于 2017-12-27 14:11

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小工具登录不上

看这里：https://www.shengxin.ren/question/677

回答于 2017-12-26 13:09

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DESeq2分析差异基因报错

检查你的输入数据对象，代码没有问题，数据的问题

回答于 2017-12-26 13:08

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为什么运行TCGA简易下载工具-V8出现这种情况

首先检查一下你的电脑是否是32bit的，其次看一下你的电脑用户名是否是中文

回答于 2017-12-26 13:06

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自己手里有基因芯片的数据，如何用生信人的小工具进行差异分析？

整理成数据表格，如果没有做过标准化的话使用TCGA TPM转换工具里的分位数标准化进行标准化完之后，再导入DECenter，使用limma进行差异分析即可

回答于 2017-12-25 14:01