祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期
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用DECenter V4分析miRNA-Seq-BCGSC miRNA Profiling里的reads_pe...

edgR和deseq2是不支持FPKM的数据的，T检验应该是可以的，除非是你数据矩阵中存在很多0等异常情况

回答于 2017-12-14 12:53

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TCGA数据库里有circRNA的信息吗？

目前没有公开，据说是有测

回答于 2017-12-14 12:51

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老师，您好，请问绘制热图，导入的GEO芯片数据前，数据需要怎样...

绘制热图只要准备好数据即可，表达谱矩阵，当然比如几万个基因一起的热图其实没什么实际意义的

回答于 2017-12-13 17:18

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GEO芯片数据转换器

你的数据没有完全下载，无法解压，你看一下你的数据是不是有这种情况，如果有重新下载数据即可

回答于 2017-12-13 17:12

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祝老师，我在使用DEcenter时报错

版本从图，工具盒里的R版本是3.4.1的，而'GenomicRanges'是用R版本3.4.2 来建造的，最近这个包做了升级，可以打开R,手动安装一下这个包

回答于 2017-12-13 10:39

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TCGA RNA-seq FPKM为什么不能进行TPM转换

检查一下你的数据行数是否是60484行，是不是FPKM数据，如果不是的话就不支持啦

回答于 2017-12-12 14:13

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关掉工具盒可以了 运行成功 但是导出时出现了错误 如图

图丢了。。。。。。。

回答于 2017-12-11 17:48

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GSEA软件分析相关的问题

不应该的，基本上两者是相反的结果而已

回答于 2017-12-11 17:48

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DECenterV5 两个不方便的设置~

收到，以后尽可能优化

回答于 2017-12-11 17:47

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下载BCGSC miRNA Profiling（ISOFORM）后无法合并应该怎么解决

isoform这个操作比较复杂，目前小工具并不支持

回答于 2017-12-11 17:45