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  • zty 2020-08-25 07:21

老师您好，通过v16下载miRNA Profiling ISOFORM，合并后得到两个文件如下图，count之外的文件是FPKM数据吗？

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运行DECenter又报错了，这是什么意思啊，求指导！！！

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张老师您好，谢谢您回复了我的问题，我有一个问题想请教您，我最近在找前期实验得到的一些差异性甲基化基因与三羧酸循环中间体的关系，之前就是用了BioGraph这个网址查询，现在网址不能用了，您给我推荐的网址我看了一下好像只是做蛋白的，还有没有其他的一些方法可以分析呢？

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生信小白一枚，现在获得一株菌的全基因组，想用t检验分析这株菌氨基酸酶转运代谢，碳水化合物代谢转运代谢，细胞运动，无机离子转运等的丰度就是会出现各种百分数的？不知道用什么软件怎么分析？谢谢

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GEO便携转换器导出样本数据不全

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用R语言做热图时出错

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  • tian 2019-07-03 20:52

TCGA怎么做肿瘤不同分期的差异基因？

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TCGA下载临床数据不能合并，到哪里下载V13版本

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老师，您好，请问绘制热图，导入的GEO芯片数据前，数据需要怎样处理，怎样得到矩阵文件？谢谢

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sanger box 下载的甲基化数据点击合并文件找不到下载的数据呢？

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得到TCGA RNA-Seq的数据，请问各位大佬，标准化的公式是啥？

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10 想请教下老师关于sangerbox中数据分析的问题。

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如何将TCGA下载数据按照病人ID显示基因突变情况

2 回答

你好，sanger box里面工具启动不了

1 回答
  • Lily 2017-11-10 14:13

DECenter 里边进行差异分析，从GEO芯片转换器里边转换的矩阵格式是什么？为什么我转换出来的表达矩阵进入差异分析都提示错误呢

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请问各位老师，tcga临床数据里的吸烟史和生育史在哪里?

1 回答

您好 ，我用贵平台的简易TCGA下载工具下载TCGA-ESCA(Esophageal Carcinoma-Esophagus)数据进行转录组分析，比对后样本数与文章报道的数目不一致

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做Module−trait relationships时怎么去掉灰色模块？

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oncomine账号出现这种问题怎么解决？

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5 TCGA简易下载工具v16 里面没有膀胱癌的数据啊？怎么回事？？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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