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5 怎么利用TCGA的数据，分析A基因在B基因高表达组和低表达组的表达水平？

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  • xixi 2019-01-21 18:20

TCGA简易下载工具一直显示正在检索

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请问使用小工具下载了乳腺癌的RNA-seq数据，合并、ENSG-ID转换之后，Merge_matrix文件里面的KEY（如：ENSG00000167578.15）如何转换为常用的gene symbol？还有就是ENSG00000167578.15这代表的是TCGA里面的gene ID吗？

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TCGA小工具合并文件功能

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sangerbox为什么无法安装

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  • Z 2018-07-26 11:28

3 老师你好，下载的sanger box 找不到ava虚拟机怎么解决

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如何使用TCGA数据库分析VASH1和miR143临床样本分析表达量的正相关或负相关

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GEO 下载工具输出的表达值是经过normalized 吗？使用limma分析还需要RMA，mas5处理吗

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3 下来来了文件，程序却不识别，求助

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5 gsea分析工具总是提示样本分组错误

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5 bowtie跑colorspace出现的错误

1 回答

各位大神您们好！请问基因注释后的vcf文件怎么处理为检测报告中的诸如EGFR, c.2573T<G, p.L858R 啊？

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3 请问GSEA小工具的分类方式该怎么选择？这个方式有什么影响

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10 如何使用R语言在柱状图下面加表格？

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新box中TCGA功能如何下载样本的临床信息？

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有没有小软件能分析甲基化差异位点？

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3 TCGA简易下载工具V8运行时提示“'ascii' codec can't decode byte 0xc9 in position 7: ordinal not in range(128)”，求帮助！！

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5 RMAExpress处理cel原始数据

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简易TCGA下载工具链接不到TCGA，获取远程代理也失败

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  • gy 2017-08-01 12:30

使用TCGA简易下载工具，下载并合并CNV数据，遇到的问题

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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