2 回答

小鼠做GSEA分析。用的是GSEA软件。请问我表达数据有16000多个，但是小鼠的gmt只有14000多，老是报错，咋办啊？

1 回答

下载了64位盒子，其它小工具都可以下载，GEO转化器总是下载失败？下载进展条明明都已经加载满了，最后弹出下载失败，请重试！请问这是什么原因？

1 回答

请问Win7系统下如何安装使用TCGA2STAT-R 包？

1 回答

COBERSORT 网页版无法正常上传数据，R包申请无回复。求R包或者其他解决办法

1 回答

TCGA简易数据库转换的时候，是ENSG_ID最后一位要加上1再去biomart转换？如：ENSG00000111224.12转换为gene名的时候将ENSG00000111224.12变为ENSG00000111224.13才转换，只有这样才能得到工具转换出来的结果，为什么加上1呢？

2 回答

10 GEO下载工具：MINiML无法下载

2 回答

火山图制作，点击绘图，没反应，不出图

0 回答

picard统计dup率

2 回答

3 老师们，GEO数据转换器里ID没有gene symbol

1 回答

怎么用Ensembl和NCBI等数据库查找基因的SNP和InDel信息

2 回答

3 ensemblToSymbol.pl文件

1 回答
  • oscarwang 生信一期  星标用户 2017-05-25 13:44

TCGA数据库中无法下载SNV的数据

1 回答

请问使用小工具下载了乳腺癌的RNA-seq数据，合并、ENSG-ID转换之后，Merge_matrix文件里面的KEY（如：ENSG00000167578.15）如何转换为常用的gene symbol？还有就是ENSG00000167578.15这代表的是TCGA里面的gene ID吗？

1 回答

De-center界面是logFC和FDR，没有P值

0 回答

在MEME网站预测基序，只能得到基序的序列，但是想知道具体功能，该怎么做？求助大神！

1 回答
  • jill 2019-04-15 22:05

GEO便捷转换器导出数据矩阵是空文档，没有提示导出失败也没有提示导出成功，样本矩阵是导出成功的，电脑内存应该也是够的，请问这要怎么解决呢？谢谢各位大佬！（截图一直上传不成功请见谅）

1 回答

5 怎么利用TCGA的数据，分析A基因在B基因高表达组和低表达组的表达水平？

1 回答

GEO 下载工具输出的表达值是经过normalized 吗？使用limma分析还需要RMA，mas5处理吗

1 回答

5 TCGA简易下载功能 本地无法连接TCGA

1 回答

TCGA小工具合并文件功能

今天，你的分析遇到什么问题呢？

立即提问

热议话题 »

活跃用户 »

  1. 祝让飞 15620 经验
  2. strings 1100 经验
  3. 欢乐豆 910 经验
  4. 张海伦 1010 经验
  5. disciplinant 1450 经验
  6. TwoBeNO.1 350 经验
  7. 王诗翔 450 经验
  8. liuzhe 420 经验