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火山图画出来中间那块是空白的，不应该是黑的吗？

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  • Pham 2018-05-24 06:20

批量生存分析工具分析出来差异很明显，KM曲线差异也很明显，但在spss中去做却没有差异，怎么解释？

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请问使用小工具下载了乳腺癌的RNA-seq数据，合并、ENSG-ID转换之后，Merge_matrix文件里面的KEY（如：ENSG00000167578.15）如何转换为常用的gene symbol？还有就是ENSG00000167578.15这代表的是TCGA里面的gene ID吗？

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在MEME网站预测基序，只能得到基序的序列，但是想知道具体功能，该怎么做？求助大神！

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3 老师们，GEO数据转换器里ID没有gene symbol

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  • oscarwang 生信一期  星标用户 2017-05-25 13:44

TCGA数据库中无法下载SNV的数据

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简易热图里面，组间的聚类效果不太好怎么办？

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3 生存分析中log Rank=NA

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5 怎么利用TCGA的数据，分析A基因在B基因高表达组和低表达组的表达水平？

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TCGA简易数据库转换的时候，是ENSG_ID最后一位要加上1再去biomart转换？如：ENSG00000111224.12转换为gene名的时候将ENSG00000111224.12变为ENSG00000111224.13才转换，只有这样才能得到工具转换出来的结果，为什么加上1呢？

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10 求助关于乳腺癌TCGA数据中，随访资料相互矛盾的问题

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picard统计dup率

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5 TCGA简易下载功能 本地无法连接TCGA

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TCGA数据下载后如何分析？

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De-center界面是logFC和FDR，没有P值

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  • jill 2019-04-15 22:05

GEO便捷转换器导出数据矩阵是空文档，没有提示导出失败也没有提示导出成功，样本矩阵是导出成功的，电脑内存应该也是够的，请问这要怎么解决呢？谢谢各位大佬！（截图一直上传不成功请见谅）

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怎么用Ensembl和NCBI等数据库查找基因的SNP和InDel信息

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TCGA小工具合并文件功能

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GEO 下载工具输出的表达值是经过normalized 吗？使用limma分析还需要RMA，mas5处理吗

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3 ensemblToSymbol.pl文件

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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