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网页下载好临床数据的xml文件后 怎么读取啊？

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TCGA简易数据库转换的时候，是ENSG_ID最后一位要加上1再去biomart转换？如：ENSG00000111224.12转换为gene名的时候将ENSG00000111224.12变为ENSG00000111224.13才转换，只有这样才能得到工具转换出来的结果，为什么加上1呢？

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  • oscarwang 生信一期  星标用户 2017-05-25 13:44

TCGA数据库中无法下载SNV的数据

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10 GEO下载工具：MINiML无法下载

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picard统计dup率

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3 老师们，GEO数据转换器里ID没有gene symbol

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3 ensemblToSymbol.pl文件

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怎么用Ensembl和NCBI等数据库查找基因的SNP和InDel信息

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5 SangerBox下载的工具保存在哪个目录下，比如下载的“TCGA简易下载工具”在哪个文件夹下啊，谢谢~

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GSEA分析

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3 想知道TCGA数据库下载的癌与正常组织has-miRNA的数值是如何计算来的？标准化处理的过程？

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  • sasa 2020-08-06 08:55

10 请问SCI论文中如何引用sangerbox软件

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10 批量生存分析工具 问题求助 提交gene list 中 只有一个基因做了分析

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请问使用小工具下载了乳腺癌的RNA-seq数据，合并、ENSG-ID转换之后，Merge_matrix文件里面的KEY（如：ENSG00000167578.15）如何转换为常用的gene symbol？还有就是ENSG00000167578.15这代表的是TCGA里面的gene ID吗？

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生信盒子批量生存分析的p值与graphpad的P值不一样？？？

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  • jill 2019-03-30 23:59

TCGA ID转换后部分ID转换不了，转换导出是空白文档，请问这要怎么解决呢？转换导出是到merge.txt中还是另建新的txt文档呢？谢谢大佬！

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祝老师，我重新下载了64bit无界版，V8，打开软件后点击小工具完全没有反应？太崩溃了......................

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De-center界面是logFC和FDR，没有P值

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简易TCGA下载工具，运行报错

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sangerbox为什么无法安装

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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