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5 TCGA简易下载工具的临床随访数据中Clinical BCR Biotab,Clinical BCR XML,Clinical BCR OMF XML分别代表什么意思

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20 oncomine账号出现这种问题怎么解决？

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  • x131 2021-04-26 10:26

13 请问http://sangerbox.com/TcgaDown下载的数据是log化的，还是没有log化的？

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3 wgcna如何选软阈值

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excel 转成TXT后数据列对不齐，导入火山图软件后画出来的图不准

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TCGA简易工具下下来的CNV数据中的segment_mean是和正常组织比对之后的gain/loss的倍数吗？能否直接拿来作图？

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GEO芯片数据转换器

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GEO的series.matrix数据需要均一化么？combat小工具输出的数据读入R作为矩阵，报错呢？

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10 GDC在win10上无法运行（已解决）

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用简易工具v14下载TCGA的SNP数据该下载哪个？如VarScan2..., MuSE..., MuTect2...,还是SomaticSniper...?各是什么意思？

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TCGA RNASeq数据归一化FPKM数据可否使用Z-Score归一化

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15 请问sanger box 打开后弹出如下提示框怎么处理？ 弄了一下午，还是不知道 谢谢老师！

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  • SXR 2017-03-30 11:34

类似galaxy 一样的生信分析平台有哪些？

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请问老师们，软件里的批量生存分析用的是单变量COX回归分析吗？为什么我用批量生存分析软件计算得出与生存分析相关的基因，在多变量COX模型里得出P<0.05的基因，但是在做KM生存曲线的时候却显示生存没差异呢？

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  • LXY 2018-05-03 16:33

3 GEO芯片数据转换器得到gene symbol有误

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关于TCGA下载工具lncRNA的count和fpkm

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请问下TCGA clinical数据里A8_New_Event_Time和A1_OS里的数据完全一样，A8的数据是不是错了？谢谢！

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为什么TCGA简易数据库ENSG_ID转换得到的基因数和在Ensembl转换得到的数量不一样？

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  • SXR 2017-04-06 10:12

简易TCGA工具问题：请问这个合并文件怎么总报错呢

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lncRNA的识别

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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