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请教GEO数据库中A基因与其他2万多个基因的相关性。

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老师，麻烦问下，如何把我从isoform中的3p和5p信息结合到我用miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling筛出来的mirna呢？我想找mirna对应的mrna，谢谢老师

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heatmap运行不了

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DEcenter 差异分析小工具报错 R是3.2.5版本 好像是R包的问题 但是limma包我是装过的啊 反复安装也是一样的

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祝老师，我用便捷ID转换工具提取转录组的miRNA矩阵，结果显示转录ID为0，这是为啥

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15 GEO差异基因分析

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之前已经安装R软件了 版本是3.25，但运行DECenter简便的差异分析工具时还是提示该插件需要R才能运行。

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3 蛋白质组学数据WGCNA结果

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WGCNA分析前的数据处理

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无fast格式的探针文件（GPL18109）如何利用Seqmap序列比对工具 寻找转录本注释

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你好，你用CIBERSORT进行矩阵分解时用的FPKM还是TPM呀，效果好吗？最近我也再用这种方法，效果不好，可以讨论一下吗

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祝老师您好，我用TCGA的FPKM数据用CIBERSORT进行分解然后分组，再用组标签做生存分析时，得到的P值很大，分不开。我不确定是CIBERSORT的去卷积效果不好还是聚类的效果不好，以你的经验CIBERSORT的去卷积结果好吗，能得到好的实验结果吗

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请问大神的WGCNA GUI 的软件的下载地址在哪里？

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提示存在非法碱基，序列都是有的，请大佬指导

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您好，请问您用生信人下载的counts数据和fpkm数据中，rep的部分会对应起来吗？我的不对应。

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GSEA分析

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Homo_sapiens.GRCh38.90 中的 gene_id 的格式一定是：“大写字母+数字+（小数点+数字）”吗？

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不用r语言可以分析小工具下载的甲基化和表达的相关性吗？如何分析每个位点的甲基化

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TPM和RPM文件如何进行基因差异性分析？

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3 TCGA数据库下载的甲基化数据可以用小工具直接进行归一化处理吗？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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