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3 一键式WGCNA怎么启动？

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3 火山图

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6 火山图

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用limma包做tcga数据差异分析，应该用下图中的哪个数据？是用标准化后的还是原始数据？如果做生存分析呢？

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  • Wang 2018-12-25 23:26

10 WGCNA 尚未运行完毕,请稍后再试！

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DEC运行出错，请检查日志和数据，这是什么问题

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boxplot运行成功后只有txt,没有图片

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10 DEcenter

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10 用DECenter的Deseq2做TCGA差异分析时出现logFc和up/down regulated不一致的情况。比如logFc>1和logFc<-1的基因都有up regulated的(如图），用同样的分组信息edger都没问题，这是什么原因？谢谢

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3 TCGA seq数据6万多个基因位点ID转完后只剩1万多个，丢失了很多信息，除去没有对应的geneID还差好多，怎样才能转换完全？谢谢

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TCGA中某个单独的分子做差异分析，可以用T检验吗

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祝老师您好，想请教下用筛选到的所有差异基因做WGCNA计算TOM，总是出现NAN，但若先中数排序挑前N个做就不会有这种情况，是因为差异基因里有太多极小的FPKM值吗？那以什么原则来剔除数据呢？

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新版TCGA下载工具怎么提取临床信息呢

1 回答

5 一件WGCNA模块打开显示“该软件需装R才能使用”

1 回答
  • Meng 2018-12-20 09:32

如何打开过大的txt文件，是否有R script可以提取table中的某一行的全部列信息，感谢！

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  • Meng 2018-12-20 09:28

如何打开过大的txt文件，下载了TCGA的甲基化数据，合并后文档大于3G，无法用excel打开~请教用R语言提取其中个别基因的甲基化信息，感谢！

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DEcenter运行无反应？

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求Sanger Box的使用教程

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  • Meng 2018-12-19 20:54

10 如何打开过大的txt文件，下载了TCGA的甲基化数据，合并后文档大于3G，无法用excel打开~请教用R语言提取其中个别基因的甲基化信息，感谢！

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用r语言分析的时候提示缺少cdf环境

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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