网上看到有人说FPKM/RPKM都不对，应该用TPM，到底用哪个？
请问为什么我下载安装sangerbox后，也升级了，但是却显示本地无法连接TCGA服务器！远程代理也获取失败？
能否用TCGA中GBM的正常样本和LGG的肿瘤样本合并在一起，然后做差异分析呢？ 因为TCGA数据库中GBM（胶质母细胞瘤）数据中有5个正常样本，而在LGG（低级别胶质瘤）中却没有肿瘤样本。GBM与LGG都是脑的原发肿瘤，只是级别的差...
想在tcga数据库中查肝癌病人肿瘤中某个目标基因的RNA表达值然后进行预后分析，发现给出的Z-score大多数为负数，oncoprint页面给出只有2.2%病例表达上调，所以是要用这2.2%病例作为高表达组，剩余所有病例作为低表达组做预后分...
老师好，我用了TCGA简易下载工具下载肝癌的clinical的数据，文件中直接有OS的数据，我还想提取RFS的数据，请问我应该怎么样计算得到RFS的数据呢，是一列follow_ups.follow_up.new_tumor_events.new_tumor_event.days_to_new_tumor_event_after_initial_treat...
从公众号看到的:“ 简易TCGA下载工具-V8”这个软件，小编说在生信人社区上可以下载，怎么没有找到，谁知道呀~
如题
各位老师好，请问sangerbox里的TCGA简易下载工具里面下载数据后怎么进行ENSG-ID转换呢？原来的版本的简易下载工具里面直接有ENSG-ID转换的按钮的，新版里面好像没有呢？