已解决
我试了你们给的肝癌的例子用GSE编号搜索,依然搜不到,我想问一下你们GSEA的数据是怎么搜到的
因为卵巢癌没有癌旁,所以如果想用小工具分析差异表达的话应该怎么分组?
我用GISTIC在线分析工具如图一,seg file是直接从TCGA下载的数据(如图二),markers file是探针文件(有100W行左右,如图三),cnv file不填 然后我每次运行的结果都是错的(如图四),有大神可以告诉我是怎么回事吗?求教 图一...
TCGA中某个单独的分子做差异分析,可以用T检验吗?如果可以的话,用什么数据呢?counts还是FPKM?
下載解壓縮後,想要運行時一直出現 " 找不到指定的模組 Loadlibrary(pythondll) failed"
祝老师,您好!TCGA简易工具下载的目标mirna表达量均接近零,这个时候还能进行生信分析吗?
...链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。 TCGA数据据是由美国国家癌症研究所(NCI)及国家人类基因组研究所(NHGRI)联合建立,其包含丰富的肿瘤数据类。 那么这么多的数据如何下载,下载后怎么不用写代码分析...
一、进行TCGA数据下载一个maf格式的mutation,接受中有mutect,muse,vanscan,somaticsniper,这四个文件有什么联系。下载的MAF文件可能有两种格式 ,可能是47列,或者120列,这个对后续分析有什么影响? 二、进行TCGA数据下载后这个仅仅有...
用简易工具下载AML(Acute Myeloid Leukemia-Blood),RNAseq的FPKM数据,上面检索完有187个样本,但是下载下来之后只有一个file是怎么回事?为什么下载不下来?
TCGA里面的下载的临床XML文件是怎么转临床数据文本的?有没有相关的脚本
简易下载工具V8点击样本类型后,点击检索,一直检索不出来,怎么回事。