工具下载链接:http://gap.shengxin.ren/tool/9/ 以TCGA简易下载工具下载数据为例,首先下载工具下载之后合并矩阵会得到一个名字为:Merge_matrix.txt 的矩阵 矩阵格式上满足本工具的要求: 打开本工具界面极其简单如下: 从图中...
...常样本,疾病样本之类的,这里就给大家一个参考 使用TCGA简易下载工具可以下载所有的样本类型,具体看样本编号,在界面中只列了几个常见的,不常见的可以下载全部然后自己筛选 样本编号模式如下: 描述参考:https://wik...
从TCGA数据库GDC下载肺腺癌LUAD文件,但不知道如何区分哪些是癌,哪些是癌旁,希望前辈能指点一下。 这个问题本人先是网络检索过,看到一个答案说到: “举个样本例子给大家: TCGA-02-0001-01C-01D-0182-01 这个代码中,最重要...
简易TCGA下载工具V14无法合并临床数据情况怎么解决,等了很久,合并都没有完成。
原来的链接7天就过期了 邮箱daijin1994@pku.edu.cn
TCGA简易下载工具下载BCGSC miRNA profiling后合并成TXT文件,用归一化工具提示选择该矩阵TXT文件,但提示非TCGA数据,无法使用TPM转换,不知是什么原因?是不是miRNA不用做归一化处理啊?
谁能给我一份,从下载TCGA数据开始,到数据整理完毕的,软件使用顺序图? 我实在是不知道,下载好了数据,接下来用哪个软件继续工作的? 请教了!谢谢!
如图,合并的矩阵的结果是NA,然后文件并没有对应到样本,有办法解决吗