例如,TCGA-A7-A0DC-01_Rep917,这个Rep917代表什么意思?这几个样本如果数量不多的话可以直接删除吗?
TCGA简易下载工具下下来的CNV数据中的segment_mean是和正常组织比对之后gain/loss的倍数吗? 还要做其他的分析吗?能否直接拿来作图?
...的版本在SangerBox中,下载地址: http://sangerbox.com/ 简易TCGA不知不觉已经更新到了第八个版本,之所以更新无非是有很多同志们遇到了各种各样的需求 图中是V1-V6各个版本的细节修正问题,到了V6版本基本上已经较为完善 V7:版...
各位老师不吝赐教。谢谢
比如下面图中所说的,AKT3在胃癌中的表达情况怎么下载?具体到某个基因在某个肿瘤的表达水平,求老师指导?(菜鸟怕自己说不清楚)
TCGA简易下载工具上线一周,有许许多多的同志们使用它来下载TCGA数据,也有部分同志反应了一些问题,也是这些问题让这个工具更新到了第六个版本,经过六次的更新,也解决了不少在极端情况下的下载使用问题,现在总结一...
您好,祝老师! 按照您的建议,我今天尝试了用你们的下载工具下载了miRNA数据,下载后利用软件自带合并功能,产生了一个合并TXT文件,用Excel打开后,发现有错位现象,并且产生了一列无用的YN信息,最后两列数据没有抬头...
假设临床数据中紫衫醇和顺铂的方案的开始时间最早,是第89天,最初治疗后的肿瘤进展时间是第224天,请问这个紫衫醇加顺铂的方案可以看做最初治疗吗?如果不能,那个224天是从什么时候开始算的呢?
请问大家知不知道怎么用R把 TCGA.AA.3982.01中的 .01设置为空,也就是把TCGA.AA.3982.01变成TCGA.AA.3982这种格式。我试了半天,觉得自己的思路挺对但是结果出不来。
利用生信人TCGA下载工具获取基因表达数据,下载前看到共有529个样本,下载完529个压缩包合并后,发现EXCEL中只有256个样本,为什么呢? 临床数据下载前是522个样本,下载合并后有522个样本。这说明有一部分随访的病人没有进...