漫谈16S的前世今生

本文转载自“微微悦明”，已获授权。本人对内容有编辑和修改。 16S的基础概念 16S rDNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟，其种类少，含量大（约占细菌RNA含量的80％），分子大小...

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• 刘永鑫 发布于 2017-12-18 23:07

你想要的生物信息知识全在这——生信宝典文章目录

程序学习心得 生物信息之程序学习如何优雅的提问生信宝典视频教程好色之旅-画图三字经转录组分析的正确姿势学习生信的系列教程学习生信的系列书籍教师节献礼 - 文章用图的修改和排版简单强大的...

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• 刘永鑫 发布于 2017-12-10 11:55

Co-occurrence网络图在R中的实现

作者：陈亮 单位：中科院微生物所 编者按：上个月菌群月坛，在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验，不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识，更使我手上一个关于菌根的课题有极大...

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• 刘永鑫 发布于 2017-12-07 20:07

Nature：地球微生物组计划首发成果

Thompson LR, Sanders JG, McDonald D, Amir A, Ladau J,Locey KJ et al (2017). A communal catalogue reveals Earth’s multiscalemicrobial diversity. Nature. 本文今年11月1日在线发表，23...

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-28 15:24

Nature Reviews：拥抱未知：解析土壤微生物组的复杂性

Fierer N. Embracing the unknown: disentangling the complexities of the soil microbiome. Nature Reviews Microbiology, 15：579-590 (2017) 本文今年8月21日在线发表的综述，翻译转载自"...

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-28 12:57

宏基因组实战10. 绘制圈图-Circos安装与使用

前情提要 如果您在学习本教程中存在困难，可能因为缺少背景知识，建议先阅读本系列前期文章 宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实战2...

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-22 23:37

宏基因组实战8. 分箱宏基因组binning, MqaxBin, MetaBin, VizBin

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-21 09:25

宏基因组实战9. 组装assembly和分箱bin结果可视化—Anvi'o

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-20 20:28

宏基因组实战7. bwa序列比对, samtools查看, bedtools丰度统计

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-13 20:33

中文速读微生物组(宏基因组)前沿文献——这个可以有

写在前面 微生物组/宏基因组是当今世界生物科学的热门领域，本领域文章也比较多，有没有人在整理和翻译优秀文章的导读呢？让我们可以用母语快速浏览最新进展，并筛选符合自己口味的研究成果...

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-13 20:32

一片看懂肠道菌群在人体中的作用

## 影片信息 日文名：腸内フローラ解明！驚異の細菌パワー   中文名：肠道细菌 / 肠道花园   类型：医療健康   时长：49min   官网：http://www.nhk.or.jp/special/detail/2015/0222/  ...

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-13 20:25

宏基因组实战6. 不比对快速估计基因丰度Salmon

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-08 21:09

宏基因组实战5. sourmash基于Kmer比较数据集

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-07 08:56

宏基因组实战4.基因注释Prokka

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• 刘永鑫 发布于 2017-11-02 20:54

你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(180701)

宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强本领域的技术交流与传播，推动中国微生物组计划发展，中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号，目标为打造本领域纯干货技术及思想交流平台。

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• 刘永鑫 发布于 2017-10-31 20:15