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ConsensusClusterPlus

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简易一致性聚类分析软件（ConsensusClusterPlus）

一致性聚类是一种为确定数据集中可能的聚类的数量和成员提供定量证据的方法，例如作为微阵列基因表达。这种方法在癌症基因组学中得到了广泛应用，在那里发现了新的疾病分子亚类。一致性聚类方...

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admin 发布于 2021-10-09 17:31

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使用sigclust来评估你的聚类是否显著

看到文献中(doi:10.1080/2162402X.2017.1392427)有人使用sigclust来评估聚类是否合理，于是乎研究了这个包。 sigclust主要针对生物信息学数据(高维低样本)产生的聚类结果进行评估，一个基本假...

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祝让飞发布于 2019-02-23 14:36

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ConsensusClusterPlus未选择最优阈值的用法案例

我们常用ConsensusCluster来做聚类或者寻找分子亚型，常见的用法是考虑CDF下降坡度稳定小，比如图B、D中应该是k=5，然而有时候选择该值未必完全遵循此规律。比如这篇CCR的文章，就没有按照...

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祝让飞发布于 2018-10-08 09:10