TCGA下载 - 生信人

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TCGA简易下载工具V10更新

TCGA简易下载工具V10更新主要在于成熟体miRNA的数据合并上，支持miRNA的isoform合并，从中可以得到新的矩阵然后再使用便捷ID转换器就可以将miRNA的表达谱矩阵转换成-3p、5p的miRNA了

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在新版数据中TCGA的RNAseq数据主要提供了三种数据下载，FPKM，FPKM-UQ,Counts，如果要用edgR等筛选差异的话会下载使用Counts数据，但是笔者在过去的数据分析中发现TCGA数据使用edgR等软件筛选差...

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TCGA简易下载工具上线一周，有许许多多的同志们使用它来下载TCGA数据，也有部分同志反应了一些问题，也是这些问题让这个工具更新到了第六个版本，经过六次的更新，也解决了不少在极端情况下的下载使用问题，现在总结一下问的比较多的软件问题

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经常遇到很多人问怎么在TCGA中找到正常样本，在这里详细给大家支个招