R语言实战系列（一）——R的介绍与安装
1. R 包的下载与安装
1.1 为什么要使用R 包？ R 语言下载安装后，有很多基础函数可以使用，满足我们大部分需求。但在进行一些特定的分析时，需要用到一些人开发的R 包。 目前有很多R 包可
1.R包的下载与安装
1.1 为什么要使用R包？
R语言下载安装后，有很多基础函数可以使用，满足我们大部分需求。但在进行一些特定的分析时，需要用到一些人开发的R包。
目前有很多R包可以下载，涵盖了基础统计学、社会学、经济学、生态学、地理学、医学统计学、生物信息学等诸多方面。
1.2 R包的安装方法：
R包通常来源于以下三个地址：CRAN, github, Bioconductor
1）安装CRAN中的R包的方法为(以笔者开发的GeoTcgaData为例)：
install.packages("GeoTcgaData")
2）安装github中的R包方法为(以GeoTcgaData为例)：
在github官网(https://github.com/)上搜索GeoTcgaData
可以看到GeoTcgaData的作者为huerang，接着在R中运行以下命令就可以安装这个R包
install.packages("devtools")
devtools::install_github("huerqiang/GeoTcgaData")
3）安装Bioconductor中的R包（以clusterProfiler为例）
用浏览器搜索clusterProfiler，点击第一个
复制红框内的命令运行即可。
安装好R包后，如果要进行使用，先进行library。如library(GeoTcgaData)。
这样才可以直接使用R包中的函数。如果不进行library，则需要调用 包名::函数名。
转自：微羿科研
- 发表于 2021-03-14 09:42
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- 分类：编程语言
