查询物种基因组大小的方式

相信大家在科研工作中,难免涉及到要查询某个物种的基因组大小。那么到目前为止,已经测过序的物种的基因组大小到底去哪里查询吗。小编整理了目前已有的可供查询基因组大小的数据库,供大家选择和使用,希望能够帮到你。

1、问题介绍

相信大家在科研工作中,难免涉及到要查询某个物种的基因组大小。那么到目前为止,已经测过序的物种的基因组大小到底去哪里查询吗。

小编整理了目前已有的可供查询基因组大小的数据库,供大家选择和使用,希望能够帮到你。

2、数据库和方法介绍

 目前查询基因组大小的数据库和方法有如下几个(希望大家多多补充)

(1)NCBI --genome --物种名

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目前已经发表的文章所用到的数据,基本上NCBI上都能查询的到,这个方法基本够用。

除此之外还有一些专门用来查询基因组大小的网站。

(2)DOGS Database Of Genome Sizes)网址http://www.cbs.dtu.dk/databases/DOGS/

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其中包括植物基因组大小数据库 http://www.rbgkew.org.uk/cval/

动物基因组大小数据库:http://www.genomesize.com/

哺乳动物基因组大小数据库:http://www-3.unipv.it/webbio/dbagsdb.htm

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小编尝试了一下,貌似只有动物基因组大小数据库成功访问了, 具体的原因我不清楚,不知道是不是被墙啦。

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(3) GOLD: http://www.genomesonline.org/

另外:

真菌:http://www.zbi.ee/fungal-genomesize/

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3、具体介绍使用

由于查询功能较为简单,小编只简单的介绍一下如何利用http://www.genomesize.com/

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通过选择物种名字,点击相应的选项就可以啦。

操作简单,不再赘述。

  • 发表于 2017-03-28 20:28
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  • 分类:基因组学

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