查询物种基因组大小的方式

相信大家在科研工作中,难免涉及到要查询某个物种的基因组大小。那么到目前为止,已经测过序的物种的基因组大小到底去哪里查询吗。小编整理了目前已有的可供查询基因组大小的数据库,供大家选择和使用,希望能够帮到你。

1、问题介绍

相信大家在科研工作中,难免涉及到要查询某个物种的基因组大小。那么到目前为止,已经测过序的物种的基因组大小到底去哪里查询吗。

小编整理了目前已有的可供查询基因组大小的数据库,供大家选择和使用,希望能够帮到你。

2、数据库和方法介绍

 目前查询基因组大小的数据库和方法有如下几个(希望大家多多补充)

(1)NCBI --genome --物种名

biocc_fd15584c_8f01_48b9_b59b_6e81d1f7c9

目前已经发表的文章所用到的数据,基本上NCBI上都能查询的到,这个方法基本够用。

除此之外还有一些专门用来查询基因组大小的网站。

(2)DOGS Database Of Genome Sizes)网址http://www.cbs.dtu.dk/databases/DOGS/

biocc_2859de0b_5afb_42b4_a768_19f1c96250
其中包括植物基因组大小数据库 http://www.rbgkew.org.uk/cval/

动物基因组大小数据库:http://www.genomesize.com/

哺乳动物基因组大小数据库:http://www-3.unipv.it/webbio/dbagsdb.htm

biocc_c89010ff_f537_4b56_abae_0239afed4c

小编尝试了一下,貌似只有动物基因组大小数据库成功访问了, 具体的原因我不清楚,不知道是不是被墙啦。

biocc_3523c86d_1bfe_4738_8ca5_159e119fdb
(3) GOLD: http://www.genomesonline.org/

另外:

真菌:http://www.zbi.ee/fungal-genomesize/

biocc_b6c253db_e68c_4d23_a40a_309a12bdea

3、具体介绍使用

由于查询功能较为简单,小编只简单的介绍一下如何利用http://www.genomesize.com/

biocc_b8ab9dea_e428_439a_a555_f2e006e1b0
通过选择物种名字,点击相应的选项就可以啦。

操作简单,不再赘述。

  • 发表于 2017-03-28 20:28
  • 阅读 ( 4159 )
  • 分类:基因组学

0 条评论

请先 登录 后评论
不写代码的码农
SXR

44 篇文章

作家榜 »

  1. 祝让飞 93 文章
  2. 刘永鑫 64 文章
  3. SXR 44 文章
  4. 调研图 36 文章
  5. 张海伦 31 文章
  6. 生信分析流 28 文章
  7. 爽儿 25 文章
  8. shengxinbaodian 16 文章