祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期
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1139 个回答

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geo便捷转化器读取XML文件时出现前言中不允许有内容是什么情况

你的xml文件 格式不对，你用文本打开看看，贴一下

回答于 2018-08-08 14:35

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DEcenter分析差异基因出错

你的这个样本分组的样本名称能不能写的短一点，正常一点如图： 这么长，带引号，带空格R软件可能处理不好的

回答于 2018-08-07 19:57

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DECenter运行出错

你的基因个数有点少啊，应该还在运行的，你多等待一会试试

回答于 2018-08-07 19:55

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如何将ID_REF转化成symbol

先要看你的芯片是什么平台的，根据平台的注释信息可以得到SYMBOL

回答于 2018-08-07 19:53

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R语言分析多个GEO芯片标准化后计算差异基因

在工具盒中有一个工具 RMAExpress 可以做RMA标准化，导出表达矩阵后使用DECenter进行limma分析

回答于 2018-08-07 19:52

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TCGA下载的miRNA isoform表达谱分析

1、可以不用标准化 2、使用ID 便捷转换器可以把miRNA转换成成熟体的

回答于 2018-08-07 19:51

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Sangerbox打开以后简直小到没法用！是分辨率的问题吗？求解决

分辨率问题，目前只能修改分辨率，下一版本会改进。

回答于 2018-08-07 19:48

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用在线工具GEO2R对GSE数据的癌组织和配对癌旁组织进行差异基因分...

1、GEO2R 貌似无法进行配对检验的 2、可以用 配对T检验 3、一般认为是 符合正态的 4、“配对t检验或Wilcoxon配对检验”前不需要进行标准化 5、1例癌组织和11例配对癌旁组织”的芯片数据或RNA-Seq数据的差异基因情况，应该怎么挑选分析方法呢？可以选择配对的limma,RNA-Seq很少单独考虑配对的

回答于 2018-08-05 11:00

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VPN定制化客户端点击启动，无server configuration选项

不需要config,点击自动获取复选框，然后点击启动 就好了

回答于 2018-08-05 10:57

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GEO通过R语音分析产生差异序列分析DEG.TXT，接下来如何产生用于h...

从表达谱里面 提取差异基因的 表达谱 不就OK了

回答于 2018-08-05 10:47