祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

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1139 个回答

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R语言主成分分析

你这是相当于对8个性状做主成分分析,如果要对300个样本的话,你的数据矩阵应该转置 

回答于 2018-06-18 14:15

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平台注释文件里没有gene symble 怎么做GSEA分析??导入GSEA里显...

想办法转换成gene symbol,比如使用DAVID 的ID转换

回答于 2018-06-18 14:14

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用R主成分分析画三维图提示错误,求助

错误没有贴全,不知道是啥问题

回答于 2018-06-18 14:13

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小工具下载的HTSeq-FPKM的数据合并后的样本量和TCGA中的case数不...

有些 case 会测好几个RNA-Seq,所以会有一些差别,这属于正常情况

回答于 2018-06-18 14:11

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再次出现临床数据合并中的问题。(升级到v13版后已解决)

最近TCGA做了一些更新,开放了更多的临床随访数据,所以老版本的合并临床随访信息已经不够用了,V13版本进行了更新解决,.bak文件是临时文件,应该是在下载这个文件是存在网络断开,所以重新下载了,这个时候就会有bak这样的中间文件

回答于 2018-06-18 14:10

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BRCA的临床数据在合并时出现问题,“合并异常!前言不允许有内容...

检查一下 下载的临床随访信息是否完整 步骤如下: 1、下载临床随访信息 2、选择保存目录与已下载的一致 3、点击下载,会自动检验是否完整,完整的就不会重下,不完整的会自动重下 4、下载完,再进行合并

回答于 2018-06-15 17:24

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DECenter运行出错

电脑里 没有安装R ,需要安装R才能使用,R安装包地址:https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/bin/windows/base/R-3.5.0-win.exe

回答于 2018-06-15 15:42

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TCGA lunch data portal打不开

检查 是否浏览器的问题,换个浏览器试试 如果还是打不开的话 基本上是你那个ip访问不了

回答于 2018-06-15 11:35

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利用生信人TCGA下载工具获取基因表达数据,下载前看到共有529个...

你合并时 用的log文件是否只有部分样本?

回答于 2018-06-15 11:29