祝让飞的回答

祝让飞 - 生物信息工程师生信一期

偏执又爱折腾的精选伪IT男，求互粉！！！招募医学数据分析朋友一起探讨肿瘤信息学，微信：13456826965

向TA求助

2272金币数

15620 经验值

441个粉丝

主页被访问 30387 次,10,5.10

1139 个回答

0 赞同

你选择的这个差异方法不支持你的这个数据，要不换方法，要不换数据

回答于 2017-12-11 13:13

0 赞同

应该是样本量太大，你可以试试将命令行复制到cmd运行下看看

回答于 2017-12-11 13:12

0 赞同

目前只支持GEO的芯片数据压缩包

回答于 2017-12-11 13:10

1 赞同

最后一列有miRbase的ID，根据ID可以得到3p，5p

回答于 2017-12-11 13:06

0 赞同

转换完成之后合并的话需要重新编辑一下fileID.tmp文件的的第二列，将文件名改成现在的新文件名

回答于 2017-12-11 13:05

0 赞同

首先确定一下你朋友那边数据是否做过标准化，TCGA下载工具下载的是初始的数值，没有做过其他处理

回答于 2017-12-11 13:04

0 赞同

是的，一般情况下都是实时的

回答于 2017-12-11 13:02

0 赞同

按照既定阈值没有筛选出差异来呗，可以尝试降低阈值标准

回答于 2017-12-11 13:02

0 赞同

你指的是哪个数据，isoform里有3p，5p

回答于 2017-12-08 16:25

0 赞同

一般的调整策略是这样的，markdown来的图片太大的话不会自适应，使用百分比几乎也没有效果，也不懂为啥。。。。所以我们编辑人员对这个进行编辑时，一般使用qq的快捷键截图然后复制到对应图片处就好了，把之前的图删除掉，要全页面等宽的话点击图片然后选择100%比例即可

回答于 2017-12-08 14:36