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火山图和热图
1，你的火山图Y轴数据区间最大值可以改成50，把后面的两个小数点变成0就可以了，实在不行只能后面自己用AI修一下了 2、你的热图横轴聚类之后蓝色聚到了黄色里，你不要聚类就好了
回答于 2017-11-30 09:57
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处理数据
你这个应该是使用R保存的数据，存的时候row.names=F第一列的1,2,3就没了，header=F第一行就没了 然后你在R里要去掉的话直接 data=data[2:nrow(data),2:ncol(data)] 就好了
回答于 2017-11-30 09:54
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如何利用TCGA的miRNA profiling中的read_count求RPKM？
exon length需要你去下载对应基因组版本的gtf文件可以获得 RPM可以用，至于影响的话各有优势，结果都认的
回答于 2017-11-30 09:45
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GSE12417这一组数据，导出的样本信息格式不对。
你这个数据的注释文件格式有点问题，你需要手动处理一下这个表格，将右侧的多个相似列名的列合成一列就好了，然后将所有分号替换成空格，然后合并这些列的内容就好了
回答于 2017-11-29 20:48
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TCGA简易下载工具下载BCGSC miRNA profiling后合并成TXT文件，用...
TPM转换目前只支持TCGA的RNA-Seq的FPKM数据,miRNA的你可以不做这个处理，或者选择其他方法比如分位数标准化
回答于 2017-11-29 10:47
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TCGA miRNA数据下载后数据与其他途径下载不匹配
你这个是合并的问题，你是不是自己修改了fileID.tmp文件，你标出来的那一列对应的样本再合并时读取的数据列与其他的不同。你再检查一下
回答于 2017-11-29 10:46
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