祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

性别: 浙江 - 杭州 注册于 2017-03-25

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1139 个回答

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GSEA得出的结果不对

换个目录保存看看是不是还一样,估计是缓存的问题

回答于 2019-10-23 09:50

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GEO转化器转化GSE65195、GSE65212转化后样本信息可导出,但是矩...

是否提示导出成功,如果不是的话多等等,不行的话重启软件再试

回答于 2019-04-23 09:15

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请问老师们,从TCGA官网上利用GDC tool下载结肠癌基因表达的coun...

这是常见情况,无需担心,有些样本检测了多次,不同的软件对此处理方式不同

回答于 2019-04-22 21:12

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怎样对GEO数据进行肿瘤微环境评分?

Estimate支持芯片数据的,具体看视频:https://shengxin.ren/sxrpost/wxpayGet?sid=175 最后一个有讲

回答于 2019-04-22 21:11

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KNN法补充缺失值,duplicate row.names are not allowed

提示很明显:duplicate row.names are not allowed,你有重复的行名称,检查一下你的第一列是不是有重复的值

回答于 2019-04-22 21:10

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求问:SCDE包分析单细胞测序基因差异,使用手册中的命令不能重复...

复现了你的结果: 看提示应该是多核运算不支持的问题

回答于 2019-04-22 21:09

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多序列比对使用texshade包输出图片的问题

如果输出的是矢量图的话用AI 打开后全选设置字体就好了

回答于 2019-04-22 21:08

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用sangerbox做批量生存分析的时候结果为0

你的数据应该存在很多0,同时又存在各种很大的数值,你检查一下数据是否需要进行标准化处理

回答于 2019-04-22 21:06

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TCGA=matrix(as.numeric(as.matrix(GeneExp)),nrow=nrow(GeneExp...

题目说的很清楚呢,缺少averegs这个函数,你看一下是不是少导入了什么包

回答于 2019-04-22 21:05

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FPKM转换TPM后的分析方法

转成TPM之后可以直接用了,不需要再做归一化了

回答于 2019-04-22 21:04