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TCGA 下在某一癌型的甲基化数据（450K 平台），如何判断、筛选那些是启动子区域的甲基化位点哈……

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  • K28 2018-09-06 15:04

TCGA简易小工具合并后查到的ENSG格式的名字对应的Counts的数据请问可以使用做差异分析吗

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  • K28 2018-09-06 14:34

TCGA简易小工具下载的文件矩阵文件怎么做？

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3 tcga数据

1 回答

罕见ID转换问题

3 回答

问下Gsea和go,kegg 优势在哪，写文章如何取舍

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如何计算测序数据的链偏好性

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  • tnt 2018-08-12 22:32

GEO甲基化数据可以用DEcenter转换吗？

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特定基因与生存关系

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甲基化数据QDMR

1 回答

在做TCGA-STAD 的 RNA-seq 差异分析的时候出现了这样一个问题

0 回答

通过已知物种基因家族（按含每个domain定义）获取另一物种所有同源基因

1 回答
  • qqqq 2018-07-12 09:22

原始数据标准化以后做的DEG跟原始数据直接做的DEG不一样，做标准化的意义是什么？

2 回答
  • qqqq 2018-07-11 11:25

各位大神，低甲基化和高甲基化应该看哪个指标啊，看logfc的符号还是看deltaβ的符号

2 回答
  • qqqq 2018-07-11 11:24

各位大神，低甲基化和高甲基化应该看哪个指标啊，看logfc的符号还是看deltaβ的符号

6 回答

10 利用BRIG做基因组圈图，怎么不能显示基因组比对的信息？

1 回答

大神们，请问如何用linux命令进行序列比对及组装叶绿体，组装软件用的是platanus，有教程么？

2 回答

用GEO芯片数据转换器，选择转换id的列没有Gene Symbol这个选项怎么将ID转成基因呢？

1 回答
  • qqqq 2018-06-26 15:01

某基因在GEO快捷转换器中转换后获得的表达量文档MergeExpro文件中是2279，在DE center差异基因分析后的limma—TopExp文件中是11。这是为什么呢？

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3 我筛选出1000多个差异表达的lncRNA，做了批量生存分析之后，结果文件里只有400多个lncRNA了，这种情况正常吗？筛选的标准是什么？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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