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3 多个相同平台芯片原始数据RMA标准化后转换探针生成的表达矩阵无法应用boxplot绘图是怎么回事？

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  • K28 2018-09-06 15:04

TCGA简易小工具合并后查到的ENSG格式的名字对应的Counts的数据请问可以使用做差异分析吗

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用R主成分分析画三维图提示错误，求助

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10 Decenter分析TCGA差异基因

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10 GEO数据库下载的matrix矩阵用limma包作数据矫正后作差异分析warming：产生NANs，以至于后续差异基因热图与火山图报错

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TCGA下载肝癌counts数据，没有fileID.tmp文件，如何合并文件

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3 关于简易tcga下载工具合并后的gene count

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sangerBox 里没有TCGA ID转换呢，如何将TCGA获得的数据ID转换gene symbol?

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5 DECenter分析miRNA profiling isoform数据异常

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生信小软件火山图结果不理想

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  • Lily 2017-11-10 14:22

老师们，这个转换器到底要转换成怎么的表达矩阵才能进入DECenter进行差异分析？这个gene symbol是芯片数据吗，每次都说运行错误

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gdc下载manifest数据，每次下到一半就不能再下载了？？？

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3 差异分析

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GEO下载的数据，分析得出的结果为什么和其他实验结果相反呢？本应该上调的基因却显示下调，是因为数据选得不好吗？

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新box中TCGA功能如何下载样本的临床信息？

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请问Blast安装后如何下载并安装数据库？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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