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5 DESeq2分析转录组学数据原始数据筛选问题

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数据库挖掘,应用GEO数据转换器时候遇到问题

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老师，您好！请问用edgeR分析后的差异基因是基于什么原则排序的呢?谢谢！

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TCGA下载工具ID转换问题？

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GEPIA中所做出来的差异基因表达箱图中，为什么癌和癌旁之间有的带※有的不带※？什么意思呢？

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批量生存分析工具分析TCGA数据，部分基因没有结果，如果做标准化？

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请问下载过SangerBox软件以后，为什么启动不了里面的软件，想用里面的TCGA简易下载工具。谢谢

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有偿！有人会蛋白组学分析吗？用过蛋白数据库吗？

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有没有mac版的TCGA下载工具呢？亲们

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  • lee 2017-10-15 09:43

3 DEC小工具使用报错，求指导！

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GEO中数据的深层次分析

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GSEA数据的部分数据集分析

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TCGA里面下载了LGG和GBM，从哪里能找到相对应的正常脑组织对照？

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R：用Y叔的rvcheck更新加载包时出错。求大神指教

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  • K28 2018-09-06 14:34

TCGA简易小工具下载的文件矩阵文件怎么做？

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祝老师您好，我下载的TCGA中的乳腺癌数据，其中A2_Event和vital_status不一致，而且A1_OS和days_to_last_followup的数据不一致，但是和follow_ups.follow_up.days_to_last_followup的一致，我做生存分析时应该生存时间和生存状态应该怎么看呢？

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python实现简单BLAST功能

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DECenter v6提示：样本信息表中的样本在表达矩阵中未找到

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请问DEcenter出来的数据Top_exp数量有限制，想要所有的差异基因同时有表达值的，请问这个怎么设置，是设置FDR吗？谢谢大神们。另画热图已经用小工具里limma标准化的还要选row-zscore吗谢谢

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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