热门的问题 - 第60页

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王宏博 2019-03-15 11:42

安装JAVA和R后，运行火山图工具，显示启动完成，但是没有反应

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XiaoShi 2020-07-29 12:39

10 TCGA 成熟体miRNA数据（isoform）为什么同一肿瘤内的不同样本的miRNA数目不一样

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LooLoo 2017-09-21 00:06

5 我用edgerR包做了差异基因标准化，然后用标准化后的差异基因和随访信息做生存分析，用这个简易工具，结果只得到3个结果，满足匹配条件的336个，为啥结果这么少呢？

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十八子 2018-12-11 16:24

3 蛋白质组学数据WGCNA结果

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生信小白 2019-06-10 10:34

请问DECenter:简便的差异分析工具里的‘Wilcoxon（配对）’和‘Wilcoxon’的区别是什么呢，做mrna差异分析时使用哪个呢？

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仙道 2018-07-16 00:11

通过已知物种基因家族（按含每个domain定义）获取另一物种所有同源基因

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Lily 2017-11-10 14:22

老师们，这个转换器到底要转换成怎么的表达矩阵才能进入DECenter进行差异分析？这个gene symbol是芯片数据吗，每次都说运行错误

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宁世琦 2017-11-16 17:05

5 为什么工具下载的TCGA RNA-seq 以及 miRNA-seq 只有癌症样本，而没有正常样本

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蔡齐荣 2017-05-21 20:25

3 TCGA下载的GBM数据中哪3个文件是somatic mutation，CNV和gene expression，如何把前两者转换成0-1矩阵

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chinagjj999 2019-09-03 23:21

10 有人做过Compartment A/B吗？

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guo 2018-03-11 11:45

在用DECenter做肺癌miRNA差异表达分析时总是出现，数据有重复，可我并没有找到重复样本，怎么破？

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Tanya 2018-04-02 15:19

DEcenter问题

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Yang 2019-04-12 17:42

为什么使用批量生存分析工具结果不能显示全部基因数据

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anchor 2018-08-03 23:46

DE center里运行DESeq2做分析的时候，提示“不存在叫'DESeq2'这个名字的程辑包”，但是我系统自带的R软件已经安装了DESeq的包了，怎么解决？

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李善穷 2017-12-02 10:16

3 差异分析

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lesliechan 2017-08-09 09:10

为什么下载clinical数据的clinicalfulld过后的TXT文件乱码?

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李倩 2019-04-01 08:50

snpEff对SNP进行注释，结果列表是errors，并且没有snpEff_genes里是空的

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yongjie wang 2019-07-26 15:38

3 为什么我用用生信人box里的插件一步一步分析的数据会没有差异基因，而用GEO2R则能得到很多差异基因？

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ZZZZZZZZZZZZ 2018-09-02 22:23

用TCGA简易下载工具下载的miRNA的标本名中出现如图所示的例如_Rep445是什么意思，怎么把它去掉呢？

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franknan 2018-06-17 09:35

安装JAVA和R后，运行火山图工具，显示启动完成，但是没有反应

10 TCGA 成熟体miRNA数据（isoform）为什么同一肿瘤内的不同样本的miRNA数目不一样

5 我用edgerR包做了差异基因标准化，然后用标准化后的差异基因和随访信息做生存分析，用这个简易工具，结果只得到3个结果，满足匹配条件的336个，为啥结果这么少呢？

3 蛋白质组学数据WGCNA结果

请问DECenter:简便的差异分析工具里的‘Wilcoxon（配对）’和‘Wilcoxon’的区别是什么呢，做mrna差异分析时使用哪个呢？

通过已知物种基因家族（按含每个domain定义）获取另一物种所有同源基因

老师们，这个转换器到底要转换成怎么的表达矩阵才能进入DECenter进行差异分析？这个gene symbol是芯片数据吗，每次都说运行错误

5 为什么工具下载的TCGA RNA-seq 以及 miRNA-seq 只有癌症样本，而没有正常样本

3 TCGA下载的GBM数据中哪3个文件是somatic mutation，CNV和gene expression，如何把前两者转换成0-1矩阵

10 有人做过Compartment A/B吗？

在用DECenter做肺癌miRNA差异表达分析时总是出现，数据有重复，可我并没有找到重复样本，怎么破？

DEcenter问题

为什么使用批量生存分析工具结果不能显示全部基因数据

DE center里运行DESeq2做分析的时候，提示“不存在叫'DESeq2'这个名字的程辑包”，但是我系统自带的R软件已经安装了DESeq的包了，怎么解决？

3 差异分析

为什么下载clinical数据的clinicalfulld过后的TXT文件乱码?

snpEff对SNP进行注释，结果列表是errors，并且没有snpEff_genes里是空的

3 为什么我用用生信人box里的插件一步一步分析的数据会没有差异基因，而用GEO2R则能得到很多差异基因？

用TCGA简易下载工具下载的miRNA的标本名中出现如图所示的例如_Rep445是什么意思，怎么把它去掉呢？

6 再次出现临床数据合并中的问题。（升级到v13版后已解决）

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