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5 DECenter分析miRNA profiling isoform数据异常

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Geo转化器转出来的样本信息是文本格式 但是同学的是exl的是为什么

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通过已知物种基因家族（按含每个domain定义）获取另一物种所有同源基因

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  • zjc 2017-09-18 15:28

GSE2034这个数据库我怎么用GEO转换器导出样本信息，没有乳腺癌亚型的信息呢？看别人发的文章也是用这个数据库，应该石油乳腺癌亚型信息的

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  • xkw 2017-09-17 21:01

3 TGCA下载的ClinicalFull_matrix.txt下来的哪一列代表生存时间？

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6 运行orthomcl时，orthomclPairs这一步，只有两个物种被聚类了，其他物种在结果文件中根本没有

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5 为什么我WGCNA富集到的同一个模块中（比如蓝色模块）的基因既有上调的又有下调的？

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筛选差异基因，做了GO KEGG PPI，下一步需要做什么，有什么作图软件推荐吗

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如何用BRB对多个GEO数据集进行差异基因筛选

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  • wu 2019-04-10 01:14

3 title:Identification of invasion‑metastasis‑associated microRNAs in hepatocellular carcinoma based on bioinformatic analysis and experimental validation.

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ICGC数据库提取的normalized_read_count数据是怎么算出来的？要做差异的话是，可以直接用limma包吗？还是用DESeq2或者edgeR？为什么？

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TCGA小工具下载来的数据用DESeq包，自己摸索了大半天，还是不行，求大神指导

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R中安装包出现非0退出状态怎么办

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请问TCGA的泛癌症数据集如何下载

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TCGA简易下载工具下载BCGSC miRNA profiling后合并成TXT文件，用归一化工具提示选择矩阵

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TCGA下载肝癌counts数据，没有fileID.tmp文件，如何合并文件

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SRA BLAST有用吗？

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