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10 BCGSC miRNA Profiling

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5 DECenter分析miRNA profiling isoform数据异常

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  • sun 2019-10-26 10:31

sangerbox 的火山图左侧文字部分重叠

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TCGA简易下载工具v14中不同数据类型的含义

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关于差异基因表达分析结果

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TCGA小工具下载来的数据用DESeq包，自己摸索了大半天，还是不行，求大神指导

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ICGC数据库提取的normalized_read_count数据是怎么算出来的？要做差异的话是，可以直接用limma包吗？还是用DESeq2或者edgeR？为什么？

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  • ZJT 2019-04-06 02:45

WGCNA运行出错

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祝老师您好，使用 TCGA简易下载工具的 ENSG_ID转换功能自动成Merge_matrix.txt.cv 和 Merge_matrix.txt.cv.lnc ，能否理解为一个mRNA文件和一个LNC文件？但打开Merge_matrix.txt.cv 文件发现有如上面截图的基因，不太清楚还想请教一下

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经过DEcenter之后得到的结果文件差异基因文件无显示是怎么回事。

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3 不同方式下载的TCGA数据出入较大

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为什么制作热图的时候一直在显示绘图？

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  • wu 2019-04-10 01:14

3 title:Identification of invasion‑metastasis‑associated microRNAs in hepatocellular carcinoma based on bioinformatic analysis and experimental validation.

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用批量生存分析的，所有曲线logrank值都是NA

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  • LEE 2020-06-13 23:50

请问有没有遇到过GEO2R在线分析结果有重复的genesymbol，要删除重复吗？

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请问TCGA下载工具V15整理的临床信息

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  • zjc 2017-09-18 15:28

GSE2034这个数据库我怎么用GEO转换器导出样本信息，没有乳腺癌亚型的信息呢？看别人发的文章也是用这个数据库，应该石油乳腺癌亚型信息的

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3 蛋白质组学数据WGCNA结果

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3 用简易TCGA下载工具下载的miRNA-Seq-BCGSC miRNA Profiling数据，其中reads_per_million_miRNA_mapped数值与朋友在生物公司做的数值不一样呢？

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一键式wgcna一直正在运行，目录均为英文

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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