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10 TCGA简易下载下载小工具V16没有BLCA是什么情况

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利用生信人TCGA下载工具获取基因表达数据，下载前看到共有529个样本，合并后的数据只有256个样本名，为什么呢？

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  • LYL 2020-06-21 16:15

GEO芯片数据转换器表达矩阵为0

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  • 醒 生信一期 2018-06-17 16:10

平台注释文件里没有gene symble 怎么做GSEA分析？？导入GSEA里显示运行失败！！

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limma包做差异分析和T检验有什么不同？

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胃癌

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GEO2R分析的基因表达水平与GEO芯片数据转换器得到的数据为什么不一致？

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  • 武琦 生信一期 2018-09-27 09:44

Treeview绘制热图时，如何制作颜色标尺？

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你好，请问我用TCGA下载工具下载RNA-seq后，合并文件总是报错，将fileID分件分成几段或者重新下载数据也还是报错。要如何解决？

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富集分析是否可以理解为讲感兴趣的基因集对应到预先定义好的基因集，然后观察是否位于基因的一端？

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  • lily 2017-10-15 10:45

使用DECenter时显示数据出错？求指导！

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10 GSEA得出的结果不对

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10 做了一次mRNA-seq和一次lncRNA-seq（不同时间段做的），共有3组（空白，模型，药理），发现两次结果的差异基因数差别很大（仅统计mRNA数据），即（mRNA-seq测得的模型和给药组的差异基因数50个，而lncRNA-seq测得的差异基因数为1000），请问下一步应该怎么办，不知道哪次的结果是正确的，困扰了我大半年了，希望好心人帮助我解决这个难题，不然没法毕业了

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用小提琴图来可视化基因差异表达之美化过程

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  • mz 2020-04-17 09:26

如何进行TCGA数据断点续传

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  • Yuer 2019-03-10 16:35

3 GEO数据库数据导出

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请教一下，有没有人会做GATExplore的LncRNA的mapping?急

1 回答

你好 想求助一下 做全外显子基因组测序，使用gatk时 报错：找不到或无法加载主类 –jar

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TCGA数据归一工具问题

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TCGA 甲基化数据下载

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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