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  • dean 2018-10-18 17:44

SeqMap序列比对时提示序列不匹配存在非法碱基

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TCGA 甲基化数据下载

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请教一下，有没有人会做GATExplore的LncRNA的mapping?急

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富集分析是否可以理解为讲感兴趣的基因集对应到预先定义好的基因集，然后观察是否位于基因的一端？

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这回更改了英文路径，但是导出的时候又出现了软件的强制关闭。这个小软件怎么难搞，我也是晕了。

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3 用TCGA经分析后的提取的基因，然后在GEO中进行验证，两个平台的文件用什么方法进行标准化

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分享一段比较不同模型的C-index和RMS的代码

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10 lncRNA重注释中seqmap后的结果，抽提出注释信息，为什么有不符合的情况呢？

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在做TCGA-STAD 的 RNA-seq 差异分析的时候出现了这样一个问题

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5 TCGA下载工具下载的表达数据样本有后边跟着REP编号的，请问这是什么（不同阶段？重复试验？），应该怎么处理（删去？取均值？）？

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jupyter noteboke说没浏览器打不开是怎么回事？？？

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用TCGA简易工具下载的miRNA数据，合并后的值是以hg38:chr**等开头的一串数值，请教是否需要再重新转换？

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简易TCGA中下载列表中都表示什么？

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生信工具盒进行DECenter差异分析点击运行并保存跳出文件保存窗口，保存窗口弄好保存路径后出现错误提醒：先用工具盒安装R软件，安装了仍出现这样的错误提醒？求各位前辈指点，谢谢

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使用Sanger BOX中DECenter出现以下错误是怎么回事？

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10 DE Center可以分析到差异基因，但是差异基因的矩阵始终得不到，就是“Top”文件始终没有内容在里面，所以没办法做热图。

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  • Meng 2018-12-19 20:54

10 如何打开过大的txt文件，下载了TCGA的甲基化数据，合并后文档大于3G，无法用excel打开~请教用R语言提取其中个别基因的甲基化信息，感谢！

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TCGA软件寻找差异基因出错

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你好 想求助一下 做全外显子基因组测序，使用gatk时 报错：找不到或无法加载主类 –jar

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  • ZZZZ 2021-09-25 13:18

Affymetrix芯片标准化，gcrma包报错，怎么办？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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