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肿瘤研究中，发现一个比较冷门但典型的抑癌基因，呈现癌基因的特点

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SangerBox里RRA工具使用时出不来结果，显示系统找不到文件。在内置R里安装了RobustRankAggreg这个package后也没有用，还是系统找不到文件。请问您能帮我一下吗？您知道怎么解决吗？

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3 老师：生信工具盒的DECenter显示:error:dim(X)的值必需是正数,这该怎么处理呢？

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3 用TCGA经分析后的提取的基因，然后在GEO中进行验证，两个平台的文件用什么方法进行标准化

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10 RRA工具显示没有差异基因

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  • hty 2018-01-27 15:21

rna seq counts数据，进行差异分析，需要归一化么？

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箱线图绘制

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10 DE Center可以分析到差异基因，但是差异基因的矩阵始终得不到，就是“Top”文件始终没有内容在里面，所以没办法做热图。

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R包和DEseq结果不同该怎么办？

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mac电脑虚拟机运行sangerbox，提示limma不存在，怎么办，谢谢！

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  • hty 2018-01-31 20:36

decenter后的结果查不到

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有哪位老师知道检测血浆中 circulating cell-free DNA的甲基化谱 所需抽取的最小血液量，以及所需genomic DNA的上样量分别是多少？

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请问有ICGC的下载和TCGA一样是公开免费的吗？

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DEC运行报错！

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论文方法部分中该如何描述使用TCGA下载工具下载RNA-Seq的数据呢？

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SangerBox便捷ID 转换器怎么使用呢

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老师GEO数据库GSE17260中的RNAseq值能帮处理一下嘛质量控制和归一化，300RMB

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火山图点绘图没有反应

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tcga简易下载工具v16 ClinicalFull按钮在哪里

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3 DEcenter出错，请大侠们指教，表达矩阵和分组都应该没有错误。。。。是经过RMA处理转换Genesymbol和KNM处理后的表达矩阵，选择后只能显示前94个的表达矩阵，后面的1万多个基因的表达矩阵在DEcenter上面不显示。

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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