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用GEO便捷转换器得出基因有时候会出现：RTEL1 /// TNFRSF6B，请问什么意思？

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  • 杨 2019-08-18 09:29

请问如何在NCBI中下载某一物种转录组注释文件（gtf格式的）

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  • Lily 2017-11-10 14:13

DECenter 里边进行差异分析，从GEO芯片转换器里边转换的矩阵格式是什么？为什么我转换出来的表达矩阵进入差异分析都提示错误呢

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富集分析是否可以理解为讲感兴趣的基因集对应到预先定义好的基因集，然后观察是否位于基因的一端？

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miRNA差异表达 R语言程序问题

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SangerBox里RRA工具使用时出不来结果，显示系统找不到文件。在内置R里安装了RobustRankAggreg这个package后也没有用，还是系统找不到文件。请问您能帮我一下吗？您知道怎么解决吗？

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这回更改了英文路径，但是导出的时候又出现了软件的强制关闭。这个小软件怎么难搞，我也是晕了。

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  • Xiu 2018-07-23 12:34

无法连接TCGA。。。

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GEO数据转换器导出来的样本信息不全，没有生存时间状态之类的，数据矩阵没有表达数据上面全是NA

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  • jill 2019-04-03 22:28

DECenter一直卡在检查数据不动，把盒子主界面关了也还是不行，开了***也还是不行，请问各路大神这要怎么解决呢？谢谢！

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祝老师，我走hisat2+featurecounts+DESeq2得到count矩阵，对ensemble ID进行symbol转换时，存在多个ID对应一个symbol的情况，请问count矩阵应该怎么合并基因count表达值，有代码可以参考吗？

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请问单因素生存分析工具中，最佳cut off是如何决定的？

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5 WGCNA 尚未运行完毕,请稍后再试！

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  • tian 2019-07-03 20:52

TCGA怎么做肿瘤不同分期的差异基因？

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请教一下，为什么用工具分析TCGA生存的数据，为什么一直出现下面的情况？

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  • Puxi 2020-04-09 17:59

15 请问在使用gtfToGenePred遇到了all the members must be on same seq and strand的报错，该如何解决？

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祝老师，请教一下用survivalROC的时候时间节点取3年，那三年内的失访数据的实际状态是按什么算的呢，既不是0也不是1呀

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TPM后不能关联fileID

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  • tian 2018-05-02 16:06

GEO芯片转换器

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如何用TCGA下载小工具merge以后得到RPKM而不是counts的合并数据？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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