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生信人工具盒永久下载地址中下载资料，为什么不能解压啊？谢谢

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  • Z 2017-11-10 16:27

火山图左侧有重叠

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  • Lily 2017-11-10 14:22

老师们，这个转换器到底要转换成怎么的表达矩阵才能进入DECenter进行差异分析？这个gene symbol是芯片数据吗，每次都说运行错误

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  • Lily 2017-11-10 14:13

DECenter 里边进行差异分析，从GEO芯片转换器里边转换的矩阵格式是什么？为什么我转换出来的表达矩阵进入差异分析都提示错误呢

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30 用DE-centerV4 edgr 分析TCGA数据 快三个小时，没结果也不显示失败，请问大家有什么办法呢？

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3 DEG center能否分析自己的数据，不用先按照GEO芯片数据转换器处理数据？

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3 关于TCGA下载工具里的ENSG-ID转换，请问只能自己一个个的选中转换么？不能批量转换么？

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GEO芯片数据转换器

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GEO芯片转换器

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10 DECenter

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请问，通过TCGA简易工具下载的miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling（数据类型是芯片数据吗？）可以做miRNA差异表达分析吗？如果可以的话，用DECenter小工具时应选的方法是limma(芯片），还是edgR（counts数据）

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用DEG center 或者用R语言的limma包进行差异分析，将FDR设置为0.05，log2FC为1时，没有结果

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jupyter noteboke说没浏览器打不开是怎么回事？？？

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3 用mirna做生存分析 如何确定具体是哪个mirna

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用Bioconductor中的stringDB包做PPI分析，结果中没有degree值，PPI的富集分析也有问题，应该怎么办？

1 回答

请教使用批量生存工具做生存分析提示没有匹配到样本信息。

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3 请问，ENSD_ID 转换后，mRNA和LncRNA 有几百个共同的交集ID，这部分该怎么处理

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用r的edgeR包跑出来的结果与DECenter中的结果不符

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  • tnt 2017-11-07 10:03

用DECentre老是闪退，导入矩阵数据后就出现程序停止运行

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5 DEseq，这是出现什么错误了？同样的数据用decenter 中其他方法算差异就可以

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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