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王蕊琪 2020-10-10 19:40

祝老师您好，我是TCGA数据挖掘萌新一枚，想问一下为什么我的TCGA简易下载工具启动后有弹窗，但是不加载数据。

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gaoyang8992 2020-10-09 16:52

在sangerbox 单基因泛癌快速综合分析工具中分析的结果文档无法下载，是什么原因

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曾大夫 2020-10-09 15:54

怎么在TCGA数据库中查找肿瘤样本的微卫星（microsatellite）信息？

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krisxuan 2020-10-08 12:33

绘制热图与预后评分关系的简易工具无法使用

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wanli ma 2020-10-07 21:50

5 miRNA前体（pre-miRNA)引物的设计

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T. 2020-10-05 14:56

R语言中的错误代码什么意思？怎么改？

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cbj625 2020-10-04 15:16

3 KOBAS3.0最近怎么打不开了，有没有大神知道怎么解决的

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李春飞 2020-09-26 15:41

TCGA简易下载工具缺少TCGA-COAD数据集

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小虾米 2020-09-26 13:01

ICGC数据库提取的normalized_read_count数据是怎么算出来的？要做差异的话是，可以直接用limma包吗？还是用DESeq2或者edgeR？为什么？

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任红标 2020-09-25 15:04

3 求seqmap序列比对工具（64bit）,谢谢大佬

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yuyi 2020-09-24 23:49

3 如何上interdom蛋白质结构域数据库

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dukepck 2020-09-22 22:52

TCGA下载的RNA-seq数据（TXT），如何根据JSON患者数据合并

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Haoda Wu 2020-09-22 18:01

已经按照教程设置了java和R，但是点击“工具”中的内容无响应

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多肽 2020-09-21 09:05

多肽药物，什么是多肽药物

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min xu 2020-09-20 13:57

做了一次mRNA-seq和一次lncRNA-seq，同样的空白，模型，药理处理的方式，两者的差异基因数相差很大（比如mRNA-seq的模型vs药理有100和差异基因，而lncRNA-seq有1000个）--单纯比较mRNA的差异基因）

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min xu 2020-09-20 13:34

10 做了一次mRNA-seq和一次lncRNA-seq（不同时间段做的），共有3组（空白，模型，药理），发现两次结果的差异基因数差别很大（仅统计mRNA数据），即（mRNA-seq测得的模型和给药组的差异基因数50个，而lncRNA-seq测得的差异基因数为1000），请问下一步应该怎么办，不知道哪次的结果是正确的，困扰了我大半年了，希望好心人帮助我解决这个难题，不然没法毕业了

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min xu 2020-09-20 11:01

3 请问样品相关系数用的基因原始数据，是否要取log2

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姜花花 2020-09-13 20:18

祝老师您好，我是TCGA数据挖掘萌新一枚，想问一下为什么我的TCGA简易下载工具启动后有弹窗，但是不加载数据。

在sangerbox 单基因泛癌快速综合分析工具中分析的结果文档无法下载，是什么原因

相关系数热图时候出现正在绘图和不能出现变量名称的情况，变量名称是sample1，sample2，sample3........

相关系数热图时候出现正在绘图和不能出现变量名称的情况，变量名称是sample1，sample2，sample3........

怎么在TCGA数据库中查找肿瘤样本的微卫星（microsatellite）信息？

绘制热图与预后评分关系的简易工具无法使用

5 miRNA前体（pre-miRNA)引物的设计

R语言中的错误代码什么意思？怎么改？

3 KOBAS3.0最近怎么打不开了，有没有大神知道怎么解决的

TCGA简易下载工具缺少TCGA-COAD数据集

ICGC数据库提取的normalized_read_count数据是怎么算出来的？要做差异的话是，可以直接用limma包吗？还是用DESeq2或者edgeR？为什么？

3 求seqmap序列比对工具（64bit）,谢谢大佬

3 如何上interdom蛋白质结构域数据库

TCGA下载的RNA-seq数据（TXT），如何根据JSON患者数据合并

已经按照教程设置了java和R，但是点击“工具”中的内容无响应

多肽药物，什么是多肽药物

做了一次mRNA-seq和一次lncRNA-seq，同样的空白，模型，药理处理的方式，两者的差异基因数相差很大（比如mRNA-seq的模型vs药理有100和差异基因，而lncRNA-seq有1000个）--单纯比较mRNA的差异基因）

3 请问样品相关系数用的基因原始数据，是否要取log2

3 TCGA数据构建预后模型，如何用多个不同的GEO数据集去验证预后模型？

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