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3 老师：生信工具盒的DECenter显示:error:dim(X)的值必需是正数,这该怎么处理呢？

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祝老师你好，同样的数据用GSEA小工具去做，其它选项都没变，但每次结果都有小的差异（如下图），不知是什么问题呢？

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5 我用ID小工具转化出来lncRNA没有样本数据呢？就是一行就是基因信息了

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3 如何把基因ID批量转换为gene semble？

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为什么sangerbox中的工具显示启动完成但没有反应？不弹出窗口。

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为什么sangerbox中的工具显示启动完成但没有反应？不弹出窗口。

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老师，原来的生信人工具盒不能用了吗？

1 回答

WGCNA分析， 性状文件中，有一些样本的部分性状值缺失，需要把该样本剔除吗？还是不用剔除？

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3 做WGCNA只需要肿瘤的表达数据和临床数据，而不需要癌旁的基因表达数据吗？

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下载工具打不开

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  • liu 2018-07-17 23:56

5 GEO数据库下载后没有gene symbol

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生存分析所得p值与生存曲线logrank值不同

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下载了sangerbox之后并且安装Java和Rscript，点击启动软件显示下载完成后启动成功但是无任何响应！无法打开任何工具软件！

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GSEA中FDR都是1的问题

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3 TCGA数据库下载下来的数据从哪里看数据的变量名代表什么含义啊？谢谢

1 回答

WGCNA在选择软阈值时出现如下图这个问题是什么错误，该怎么解决？

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3 用TCGA下载的FPKM数据分析差异基因表达不是不符合正态分布吗？不能用Limma，或T检验分析差异基因，同时也不能用DEseq或edgeR分析，那如何分析FPKM数据的差异表达？

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  • THX 2018-07-16 10:51

8 关于SRA下载fastq文件的问题

1 回答

在做TCGA-STAD 的 RNA-seq 差异分析的时候出现了这样一个问题

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通过已知物种基因家族（按含每个domain定义）获取另一物种所有同源基因

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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