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TCGA、GEO、GSEA富集分析套路解析!
无论你是要看某个基因是否差异表达或者筛选某个GEO数据集的差异基因,这个方法绝对能够帮助你事半功倍 首先假设你已经找到了一套数据GSE32323 这套数据共包含44个样本,其中有17个配对的癌与...
以下我们使用GEO的一套数据来演示以下该工具使用 首先我们选择下载GSE25065数据集,下载之后使用GEO芯片数据转换器将数据提取出来,最终我们得到了这两个文件 打开SampleInfo.xls文件找到随访...
以GEO芯片数据GSE14520为例: 首先从GEO下载GSE14520数据: 从图中可以看出共有488个样本,我们选择MINiML格式的数据(软件只支持该格式),下载完: 然后我们将该文件导入到软件中: 从图...
随着微阵列芯片技术尤其是基因芯片的广泛应用,产生了海量的数据,为基因研究提供了大量的高通量数据资料,而GEO数据库就是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源。用户不仅可以上传自己的数...
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