肿瘤 - 生信人

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文献解读（5）具有丰富瘤内CD103+CD8 + T细胞的胃癌免疫原性亚型的鉴定和验证

CD103 + CD8 + T细胞可能是预测胃癌患者预后和治疗效果的有用标志物。致力于增加肿瘤内CD103 + CD8 + T细胞频率可能是胃癌的一种新的治疗策略。

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柚子发布于 2020-04-14 15:38

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文献分享（4）联合抑制PD-L2和TGF-β2可能会提高免疫治疗的效果？

缩写： PD-1：Programmed cell death protein 1（程序性细胞死亡蛋白1） PD-L2：Programmed death ligand-2（程序性死亡蛋白配体-2） PDAC：pancreatic ductal adenocarcinoma（胰腺导管腺癌） OS：overall survival（整体生存）

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柚子发布于 2019-11-25 19:12

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文献分享（1）肿瘤细胞和正常细胞之间mRNA丰度的关联

肿瘤是由良性和恶性细胞组成的复杂混合物，这两类细胞共同构成了相互关联的肿瘤微环境。在肿瘤研究中，只有分析多个细胞群的组合才能去真正了解肿瘤临床表型的进展和起源。在这篇文章中，作者去刻画了组织样本、分解后的肿瘤细胞和正常细胞之间mRNA丰度的关联，发现使用分解后的肿瘤细胞mRNA表达谱较组织样本的mRNA表达谱去对肿瘤进行研究，前者能识别更鲁棒的基因标志物。总结来说，就是通过计算机模拟分解的肿瘤细胞和正常细胞mRNA表达有利于肿瘤之间复杂的转录网络、微环境和癌症侵袭的研究。

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柚子发布于 2019-11-25 18:46

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文章分享（七）m1A甲基化酶基因竟与mTOR存在可靠的联系？

这篇文章研究分析了五种胃肠道肿瘤（GI）患者的TCGA数据。利用cBioPortal的数据，研究了9种已知的癌症m1A相关酶的分子特征。利用多种生物信息学方法，研究了m1A调控因子对其下游信号通路的影响。为了进一步证实这一调控，还利用已发表的数据库中的RNA-seq数据，研究了m1A writer基因 ALKBH3敲除的效果。

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柚子发布于 2019-07-29 10:19

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文章分享（一）What？肿瘤纯度是一个潜在的关键因素

在胶质瘤组织中不仅仅只包含胶质瘤细胞，也存在与胶质瘤相关的非肿瘤细胞，如基质细胞以及免疫细胞。这些非肿瘤细胞稀释了胶质瘤细胞的纯度，并且在胶质瘤的生物学过程中起到重要作用，但是胶质瘤纯度变化的影响仍不是十分清楚，这篇文章旨在研究这个问题。

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柚子发布于 2019-07-25 10:07

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做肿瘤学研究，这些常见的术语你知道吗?

Oncologists — doctors who treat cancer — use many terms when they talk about this disease. These terms usually have very specific meanings that are important in cancer research, specifically in clinical trials. Your doctor may also use these ter