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近期可以模仿的数据分析pipeline汇总

本次文章很多，需要细品，再仔细品。

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• 生信分析流 发布于 2019-10-28 19:51

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芦笋基因组揭示了Y染色体的起源和进化

背景 有花植物中，雌雄异株的植物仅占6%，涵盖约200个科60个属的14600个物种。所有雌雄异株植物有可能进化出性染色体，其中簸箕柳和芦笋等植物的同型性染色体处于进化早期。通常认为植物性染...

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• 张海伦 发布于 2017-11-06 20:49

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基因组去哪儿了

今天跟大家解读下发在gigascience上的三篇基因组文章：大额牛、椰子和人参。

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• 张海伦 发布于 2017-10-14 10:57

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干货|基因注释方法论

简单介绍基因预测方法 现如今随着测序技术的发展，组装一个完整的基因组也是越来越普遍，价格已经不像前些年那样昂贵（当然超大基因组除外），待基因组组装完成后，基因预测将会是接下来需要进...

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• 张海伦 发布于 2017-08-02 20:36

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纯三代向日葵基因组登上Nature

看见文章小编只能说“又一个基因组被纯三代测序组装给攻克了”，吃瓜子群众看好了！ 研究背景   向日葵是重要的经济作物，其地位，小编不阐述了。想象一下，闲来无事，看看电视，嗑嗑瓜子是...

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• 百迈客 发布于 2017-05-25 07:26

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欧洲银桦基因组登上Nature genetics！

最近随着三代测序的火热，纯三代的基因组文章也遍地开花！技术的提升必然带来的基因组质量的提升，但是对做研究而言，最终还是得落到物种自身。下面这篇文章告诉你，没有熊猫血，怎么关注爆表。...

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• 百迈客 发布于 2017-05-16 17:50

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茶基因组解析

茶是世界上最古老，最受欢迎的含咖啡因的饮料，具有极大的经济，药用和文化价值。栽培茶树山茶的重复序列高达80.9％，基因组大小伟3.02Gb。文章发现，由于几个LTR反转录转座子家族的缓慢，稳定...

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• 百迈客 发布于 2017-05-05 16:55

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海马基因组文章解读

  斯须九重真龙出， 一洗万古凡马空。   龙是中国人的图腾，可以目前尚不确定其是否存在，目前也更没有相关的基因组研究，但是16年测过一个海龙科的物种，也就是海马基因组。接下来详细的给大家...

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• SXR 发布于 2017-05-04 09:24

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N50多少，证明组装的好？

N50如何评估组装效果

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• SXR 发布于 2017-04-06 09:42

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测序各种名词解释，都在这里

收集的各种测序名词解释，Contig，Assembly，等等都在这里了

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• SXR 发布于 2017-04-05 09:49

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干货：基因组注释详解

基因组注释(Genome annotation) 是利用生物信息学方法和工具，对基因组所有基因和其他结构高通量注释，是当前研究的一个热点。 基因组注释主要包括五个研究方向： （1）重复序列的识别...

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• SXR 发布于 2017-04-01 09:19

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三思而后行的基因组项目

基因组做之前的准备工作。

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• SXR 发布于 2017-03-30 22:08

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Genewise预测假基因的注意事项

1、genewise简介 Genewise软件是大家在基因组项目中经常用到的软件，可能主要用也基因预 测和假基因预测。基因预测以往的文章都提及过，对于假基因预测这部分，也说过，但是总觉得有一些注...

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• SXR 发布于 2017-03-30 21:36

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查询物种基因组大小的方式

相信大家在科研工作中，难免涉及到要查询某个物种的基因组大小。那么到目前为止，已经测过序的物种的基因组大小到底去哪里查询吗。小编整理了目前已有的可供查询基因组大小的数据库，供大家选择和使用，希望能够帮到你。

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• SXR 发布于 2017-03-28 20:28