17年Molecular Plant水稻数据库RIGW介绍
水稻数据库又发表了。
好多人问小编，数据库能发文章吗。
不要问这么有哲学性的问题，好不好。
10月15日，华中农业大学的RIGW数据库发表在了Molecular Plant上。
看看小编最近给大家介绍的猪的circRNA数据库，眼睛表达谱数据库，血液RNA数据库，还有这个水稻基因组数据库（水稻的都发了很多了）。
如何盘活存量数据，小编认为是趋势。
华中农大这个数据库Rice Information GateWay (RIGW): A Comprehensive Bioinformatics Platform for Indica Rice Genomes
早在16年就已经有了。但是当时的基因组数据质量太差，所以并没有引起注意。关键点在于随着三代测序技术的发展，
水稻完成图的获得成为可能。所以水稻数据库才能再一次发表。
之前小编有文章解读过中科院发表的水稻完成图，仅仅是技术分析，介绍组装的质量，发表了nature communication。
华农又一次的水稻完成图，数据库发表在Molecular Plant。
水稻质量更新了可以发基因组文章，也可以发数据库。10+8，何乐而不为。
水稻都又发了，棉花，大豆，茄子，黄瓜。。。。还等啥呢。
RIGW数据库内容其实并不是很多。
首页如下，其中包括基因组的指标和注释信息、基因的检索和查询、基因组浏览器、特有的通路介绍、分析工具、数据下载等。
部分分析工具如下：blast、基因家族分析、蛋白互作网络、基因编辑设计（亮点）、共线性、水稻相关文献查找工具、基因表达、kegg通路分析。
我们打开看下PPI，随意丢两个基因，看效果还可以。
- 发表于 2017-10-16 13:38
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- 分类：基因组学
