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当我们拿到表达谱数据之后,做差异分析之前,有两个关键信息需要确认,一个是 数据类型(芯片数据、FPKM、TPM、Count),一个是 哪些样本作为参照物,哪些样本作为 处理组样本,也就是 谁相对于谁的 差异,这这里我们开发了一个基于(芯片数据和TPM)数据的差异分析工具,支持wilcox.test/t.test/limma 三种方法。
输入界面如下:
点击开始分析-》输入 任务名称-》耐心等待运行完成
载入结果之后 在页面下方 有三个 面板,分别对应 火山图、热图、和 差异结果 三个部分的细节调整
火山图 界面 调整如下:
热图界面调整如下:
差异结果导出
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