limma快速差异分析工具

当我们拿到表达谱数据之后,做差异分析之前,有两个关键信息需要确认,一个是 数据类型(芯片数据、FPKM、TPM、Count),一个是 哪些样本作为参照物,哪些样本作为 处理组样本,也就是 谁相对于...

当我们拿到表达谱数据之后,做差异分析之前,有两个关键信息需要确认,一个是 数据类型(芯片数据、FPKM、TPM、Count),一个是 哪些样本作为参照物,哪些样本作为 处理组样本,也就是 谁相对于谁的 差异,这这里我们开发了一个基于(芯片数据和TPM)数据的差异分析工具,支持wilcox.test/t.test/limma 三种方法。

输入界面如下:

attachments-2021-08-hSHHymSw611dd48f08785.png

点击开始分析-》输入 任务名称-》耐心等待运行完成

attachments-2021-08-qNJWkO7e611dcef3d63f8.pngattachments-2021-08-ice213Fv611dcf375e55a.png




载入结果之后 在页面下方 有三个 面板,分别对应 火山图、热图、和 差异结果 三个部分的细节调整

attachments-2021-08-orjmLwxu611dcf6e4250e.png

火山图 界面 调整如下:

attachments-2021-08-uLcf5jNH611dd0a4c853a.png

热图界面调整如下:

attachments-2021-08-duPiRJwd611dd189d1139.png差异结果摘要

attachments-2021-08-Kst0XhRA611dd1ceacccf.png

差异结果导出

attachments-2021-08-DqOXKmvd611dd25fad560.png

  • 发表于 2021-08-19 11:49
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  • 分类:软件工具

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不写代码的码农
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