零代码对不同类型的RNA Seq数据进行差异分析
TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。本节主要讲解TCGA中不同类型RNA-Seq数据差异分析方法。
上一节课我们已经将三种类型的数据准备和预处理完成，那么本节将讲解怎么对三种数据进行降维，缩小目标基因范围，不错有的小伙伴已经猜到了，差异分析是我们目前最为普遍的方法，但是针对不多的数据类型该使用哪种统计方法比较合理呢，我们且听老师讲解
1、差异分析同样可以使用SangerBox中的DEcenter差异分析工具，没有用过的小伙伴可以点开连接看一下哦
2、先是mRNA差异分析，输入表达数据比较容易，样本文件格式如何，生成的具体操作
3、miRNA首先对数据进行过滤，通过excel的实现过程，然后是差异分析方法选择
4、工具生成差异分析结果文件的解析
5、最后是lncRNA数据类型的寻找差异基因的步骤
本节课程完毕，下一节课将开始讲解miRNA与mRNA的网络构建
- 发表于 2018-11-16 13:31
- 阅读 ( 4940 )
- 分类：基因组学
