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之前给大家分享了一篇零实验成本的基因家族分析文章(用公共数据发文章-基因家族分析好思路)。作者在Phytozome数据库下载了木薯基因组,在Pfam数据库下载了NBS蛋白保守结构域的隐马尔科夫文件,分析了木薯NBS基因家族,研究结果发表在了BMC Genomics杂志。
分析前提:
想要分析一个物种的某个基因家族需要具备两个条件:
第一是要有物种的基因组信息;
第二是待分析的基因家族的蛋白质保守结构域需要有隐马尔科夫模型矩阵文件(也就是hmm文件)。
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