对方向扔了一个赤果果的生信分析SCI思路

很久没有写稿子了，今天给大家分享一篇纯生信的SCI,思路简单粗暴。文章2017年发表在Oncotarget上(虽然已经牺牲了)，但是我们可以取其精华呀，只要还有值得我们学习的地方，我们就挖掘出来。

很久没有写稿子了，今天给大家分享一篇纯生信的SCI,思路简单粗暴。

文章2017年发表在Oncotarget上(虽然已经牺牲了)，但是我们可以取其精华呀，只要还有值得我们学习的地方，我们就挖掘出来。

摘要部分看完大概知道文章找了些结直肠癌中差异的上百了lncRNA,后来从中缩小到了8个lncRNA,然后弄了一个基于SVM的风险分类模型来区分早期结直肠癌中的高风险病人，然后还做了通路富集分析啦。

首先用第一个数据集GSE37892做了差异分析（分组是early stage Vs. advanced stage），找到几百个差异lncRNA,然后分层聚类分析下，明显分层两类，虽然有点点小瑕疵，效果还算不错。

然后顺便比较了用差异基因分出的两组病人的生存分析（kaplan-meier），这种结果根本不用想肯定会比较好啦，用差异基因分出来的组，几乎就是在做advanced stage跟early stage组的生存率比较，不符合才怪呢。总不可能就用上百个基因这么去分类吧，因此接下来作者用随机森林（random forest supervised classification algorithm）算法做了降维处理（有个R包可以做啦），筛选了8个lncRNA。